Department für Chromosomenbiologie

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• 265 Artikel
• 15 Review
• 7 Short Communication
• 5 Beitrag in Buch/Sammelband
• 12 Mehr
  • 5 Editorial
  • 2 Correction
  • 1 Paper
  • 1 Meeting Abstract/Conference Paper
  • 1 Sonstiges
  • 1 Patentschrift
  • 1 Working Paper

Publikationen pro Jahr

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Suchergebnisse

• 2018

  BRCA1-BARD1 associate with the synaptonemal complex and pro-crossover factors and influence RAD-51 dynamics during Caenorhabditis elegans meiosis

  Janisiw, E., Dello Stritto, M. R., Jantsch, V. & Silva, N., Nov. 2018, in: PLoS Genetics. 14, 11, 30 S., e1007653.

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  Open Access

• C. elegans ZHP-4 is required at multiple distinct steps in the formation of crossovers and their transition to segregation competent chiasmata

  Nguyen, H., Labella, S., Silva, N., Jantsch, V. & Zetka, M., Okt. 2018, in: PLoS Genetics. 14, 10, 32 S., e1007776.

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  Open Access

• Chromospheric activity catalogue of 4454 cool stars. Questioning the active branch of stellar activity cycles

  Boro Saikia, S., Marvin, C. J., Jeffers, S. V., Reiners, A., Cameron, R., Marsden, S. C., Petit, P., Warnecke, J. & Yadav, A. P., Aug. 2018, in: Astronomy & Astrophysics. 616, 23 S., A108.

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  Open Access

  • Cool Stars 100%
  • Stellar Activity 100%
  • Solar Dynamo 20%
  • High Resolution 20%
  • Main Sequence Stars 20%

• Genetic interactions between specific chromosome copy number alterations dictate complex aneuploidy patterns

  Ravichandran, M. C., Fink, S., Clarke, M. N., Hofer, F. C. & Campbell, C. S., 1 Dez. 2018, in: Genes & Development. 32, 23-24, S. 1485-1498 14 S.

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  Open Access

• Initiation of Meiotic Development Is Controlled by Three Post-transcriptional Pathways in Caenorhabditis elegans

  Mohammad, A., Vanden Broek, K., Wang, C., Daryabeigi, A., Jantsch, V., Hansen, D. & Schedl, T., Aug. 2018, in: Genetics: a periodical record of investigations bearing on heredity and variation. 209, 4, S. 1197-1224 28 S.

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  Open Access

• LEM-3 is a midbody-tethered DNA nuclease that resolves chromatin bridges during late mitosis

  Hong, Y., Sonneville, R., Wang, B., Scheidt, V., Meier, B., Woglar, A., Demetriou, S., Labib, K., Jantsch, V. & Gartner, A., 20 Feb. 2018, in: Nature Communications. 9, 1, 11 S., 728.

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  Open Access

• MSF: Modulated Sub-graph Finder

  Farman, M. R., Hofacker, I. & Amman, F., 29 Aug. 2018, in: F1000Research. 2019, 7, 1346.

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  Open Access

  • Differential Gene Expression 100%
  • Gene Expression Profiling 100%
  • Expression Analysis 100%
  • External Stimulus 100%
  • Biological Phenomena and Functions Concerning the Entire Organism 50%

• Mutations that prevent methylation of cohesin render sensitivity to DNA damage in S-pombe

  Sanyal, S., Molnarova, L., Richterova, J., Huraiova, B., Benko, Z., Polakova, S., Cipakova, I., Sevcovicova, A., Gaplovska-Kysela, K., Mechtler, K., Cipak, L. & Gregan, J., Juli 2018, in: Journal of Cell Science. 131, 13, 9 S., jcs214924.

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  Open Access

• Nascent RNA signaling to yeast RNA Pol II during transcription elongation

  Klopf, E., Moes, M., Amman, F., Zimmermann, B., von Pelchrzim, F., Wagner, C. & Schroeder, R., 23 März 2018, in: PLoS ONE. 13, 3, 26 S., e0194438.

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  Open Access

  • RNA 100%
  • Transcription Elongation 100%
  • Transcription 50%
  • RNA Polymerase 33%
  • RNA Sequence 33%

• Negative Control of RpoS Synthesis by the sRNA ReaL in Pseudomonas aeruginosa

  Nguyen Thi Bach, H., Romero, D. A., Amman, F., Sorger-Domenigg, T., Tata, M., Sonnleitner, E. & Bläsi, U., 29 Okt. 2018, in: Frontiers in Microbiology. 9, 10 S., 2488.

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  Open Access

  • RpoS 100%
  • Pseudomonas aeruginosa 100%
  • Messenger RNA 66%
  • Transcription 33%
  • Quorum Sensing 33%

• Nuclear dynamics of the Set1C subunit Spp1 prepares meiotic recombination sites for break formation

  Karanyi, Z., Halasz, L., Acquaviva, L., Jonas, D., Hetey, S., Boros-Olah, B., Peng, F., Chen, D., Klein, F., Geli, V. & Szekvolgyi, L., Okt. 2018, in: Journal of Cell Biology. 217, 10, S. 3398-3415 18 S.

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  Open Access

  • Dynamics 100%
  • Meiotic Recombination 100%
  • Histone 50%
  • PHD Finger 50%
  • Chromatin Structure 50%

• Primary transcriptome analysis reveals importance of IS elements for the shaping of the transcriptional landscape of Bordetella pertussis

  Amman, F., D'Halluin, A., Antoine, R., Huot, L., Bibova, I., Keidel, K., Slupek, S., Bouquet, P., Coutte, L., Caboche, S., Locht, C., Vecerek, B. & Hot, D., 3 Juli 2018, in: RNA Biology. 15, 7, S. 967-975 9 S.

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  Open Access

• Resistance to 6-Methylpurine is Conferred by Defective Adenine Phosphoribosyltransferase in Tetrahymena.

  Akematsu, T., Findlay, A., Fukuda, Y., Pearlman, R. E., Loidl, J., Orias, E. & Hamilton, E. P., 23 März 2018, in: Genes. 9, 4, 179.

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  Open Access

• Signal transduction-dependent small regulatory RNA is involved in glutamate metabolism of the human pathogen Bordetella pertussis

  Keidel, K., Amman, F., Bibova, I., Drzmisek, J., Benes, V., Hot, D. & Vecerek, B., Nov. 2018, in: RNA. 24, 11, S. 1530-1541 12 S.

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  Open Access

  • Bordetella Pertussis 100%
  • Vaccination 50%
  • Two-Component Regulatory System 25%

• SLAM-seq defines direct gene-regulatory functions of the BRD4-MYC axis

  Muhar, M., Ebert, A., Neumann, T., Umkehrer, C., Jude, J., Wieshofer, C., Rescheneder, P., Lipp, J. J., Herzog, V. A., Reichholf, B., Cisneros, D. A., Hoffmann, T., Schlapansky, M. F., Bhat, P., von Haeseler, A., Köcher, T., Obenauf, A. C., Popow, J., Ameres, S. L. & Zuber, J., 2018, in: Science. 360, 6390, S. 800-805 6 S.

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  Open Access

  • BRD4 100%
  • Purine Synthesis 25%

• Structural prediction of protein models using distance restraints derived from cross-linking mass spectrometry data

  Orban-Nemeth, Z., Beveridge, R., Hollenstein, D. M., Rampler, E., Stranzl, T., Hudecz, O., Doblmann, J., Schloegelhofer, P. & Mechtler, K., März 2018, in: Nature Protocols. 13, 3, S. 478-494 17 S.

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  • Mass Spectrometry 100%
  • Cross-Link 100%
  • Protein Complexes 33%
  • Solution and Solubility 16%
  • DNA Template 16%

• The conserved LEM-3/Ankle1 nuclease is involved in the combinatorial regulation of meiotic recombination repair and chromosome segregation in Caenorhabditis elegans

  Hong, Y., Velkova, M., Silva, N., Jagut, M., Scheidt, V., Labib, K., Jantsch, V. & Gartner, A., Juni 2018, in: PLoS Genetics. 14, 6, 22 S., e1007453.

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  Open Access

  • Recombination Repair 100%
  • Nuclease 100%

• Transient and Partial Nuclear Lamina Disruption Promotes Chromosome Movement in Early Meiotic Prophase

  Link, J., Paouneskou, D., Velkova, M., Daryabeigi, A., Laos, T., Labella, S., Barroso, C., Pinol, S. P., Montoya, A., Kramer, H., Woglar, A., Baudrimont, A., Markert, S. M., Stigloher, C., Martinez-Perez, E., Dammermann, A., Alsheimer, M., Zetka, M. & Jantsch, V., 23 Apr. 2018, in: Developmental Cell. 45, 2, S. 212-225.e7

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  Open Access

  • Nuclear Lamina 100%
• 2017

  Adaptive sequence evolution is driven by biotic stress in a pair of orchid species (Dactylorhiza) with distinct ecological optima

  Balao Robles, F. J., Trucchi, E., Wolfe, T. M., Hao, B-H., Lorenzo, M. T., Baar, J., Sedman, L., Kosiol, C., Amman, F., Chase, M. W., Hedrén, M. & Paun, O., Juli 2017, in: Molecular Ecology. 26, 14, S. 3649-3662 14 S.

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  Open Access

  • Dactylorhiza 100%
  • Orchidaceae 100%
  • Post-Transcriptional Regulation 25%
  • Transposable Element 25%
  • Transcriptome 25%

• An engineered minimal chromosomal passenger complex reveals a role for INCENP/Sli15 spindle association in chromosome biorientation

  Fink, S., Turnbull, K., Desai, A. & Campbell, C., Apr. 2017, in: The Journal of Cell Biology (JCB). 216, 4, S. 911–923 13 S.

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  Open Access

• A Zip3-like protein plays a role in crossover formation in the SC-less meiosis of the protist Tetrahymena

  Shodhan, A., Kataoka, K., Mochizuki, K., Novatchkova, M. & Loidl, J., 15 März 2017, in: Molecular Biology of the Cell. 28, 6, S. 825-833 9 S.

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  Open Access

• BIME2, a novel gene required for interhomolog meiotic recombination in the protist model organism Tetrahymena

  Shodhan, A., Novatchkova, M. & Loidl, J., 1 Okt. 2017, in: Chromosome Research. 25, 3-4, S. 291-298 8 S.

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  Open Access

  • Protist 100%

• Centrioles initiate cilia assembly but are dispensable for maturation and maintenance in C. Elegans

  Serwas, D., Su, T. Y., Roessler, M., Wang, S. & Dammermann, A., 1 Juni 2017, in: Journal of Cell Biology. 216, 6, S. 1659-1671 13 S.

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  Open Access

• Compartmentalization of DNA Damage Response between Heterochromatin and Euchromatin Is Mediated by Distinct H2A Histone Variants

  Lorković, Z. J., Park, C., Goiser, M., Jiang, D., Kurzbauer, M. T., Schlögelhofer, P. & Berger, F., 24 Apr. 2017, in: Current Biology. 27, 8, S. 1192-1199 8 S.

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  Open Access

  • DNA Damage Response 100%
  • Histone H2A 100%
  • Heterochromatin 100%
  • Euchromatin 100%
  • Histone 66%

• E2fl1 is a meiosis-specific transcription factor in the protist Tetrahymena thermophila

  Zhang, J., Tian, M., Yan, G. X., Shodhan, A. & Miao, W., 2 Jan. 2017, in: Cell Cycle. 16, 1, S. 123-135 13 S.

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  Open Access

  • Protist 100%
  • E2F 100%
  • Tetrahymena thermophila 100%
  • Meiosis 100%
  • Transcription Factor 100%

• Genome Organization: Cohesin on the Move

  Richterova, J., Huraiova, B. & Gregan, J., 18 Mai 2017, in: Molecular Cell. 66, 4, S. 444-445 2 S.

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  Open Access

• Nonsense-mediated mRNA decay in Tetrahymena is EJC independent and requires a protozoa-specific nuclease

  Tian, M., Yang, W., Zhang, J., Dang, H., Lu, X., Fu, C. & Miao, W., 20 Juni 2017, in: Nucleic Acids Research. 45, 11, S. 6848-6863 16 S.

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  Open Access

• PARP inhibition causes premature loss of cohesion in cancer cells

  Kukolj, E., Kaufmann, T., Dick, A. E., Zeillinger, R., Gerlich, D. W. & Slade, D., 16 Okt. 2017, in: Oncotarget. 8, 61, S. 103931-103951 21 S.

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  Open Access

  • PARP1 100%
  • Sister Chromatid 66%
  • Metaphase 50%
  • Topoisomerase Inhibitor 16%
  • Anaphase 16%

• Post-meiotic DNA double-strand breaks occur in Tetrahymena, and require Topoisomerase II and Spo11

  Akematsu, T., Fukuda, Y., Garg, J., Fillingham, J. S., Pearlman, R. E. & Loidl, J., 16 Juni 2017, in: eLife. 6, e26176.

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  Open Access

• Synthesis and free radical scavenging activity of new hydroxybenzylidene hydrazines

  Sersen, F., Gregan, F., Kotora, P., Kmetova, J., Filo, J., Loos, D. & Gregan, J., 1 Juni 2017, in: Molecules. 22, 6, 11 S., 894.

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  Open Access

• Thiol-linked alkylation of RNA to assess expression dynamics

  Herzog, V. A., Reichholf, B., Neumann, T., Rescheneder, P., Bhat, P., Burkard, T. R., Wlotzka, W., von Haeseler, A., Zuber, J. & Ameres, S. L., 2017, in: Nature Methods. 14, 12, S. 1198-1204 7 S.

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  • Dynamics 100%
  • RNA 100%
  • Alkylation 100%
  • Thiol 100%
  • RNA Polymerase II 22%
• 2016

  A Surveillance System Ensures Crossover Formation in C. elegans

  Machovina, T. S., Mainpal, R., Daryabeigi, A., McGovern, O., Paouneskou, D., Labella, S., Zetka, M., Jantsch, V. & Yanowitz, J. L., 7 Nov. 2016, in: Current Biology. 26, 21, S. 2873-2884 12 S.

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  Open Access

  • Caenorhabditis elegans 100%
  • Synaptonemal Complex 100%
  • Meiosis 100%
  • Polo-Like Kinase 50%
  • Homologous Chromosome 50%

• Cdk3, a conjugation-specific cyclin-dependent kinase, is essential for the initiation of meiosis in Tetrahymena thermophila

  Yan, G. X., Zhang, J., Shodhan, A., Tian, M. & Miao, W., 16 Sept. 2016, in: Cell Cycle. 15, 18, S. 2506-2514 9 S.

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  Open Access

  • Cyclin-Dependent Kinase 4 100%

• Conservation and Variability of Meiosis Across the Eukaryotes

  Loidl, J., 23 Nov. 2016, in: Annual Review of Genetics. 50, S. 293-316 24 S.

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  • Meiosis 100%
  • Synaptonemal Complex 14%

• Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila

  Yan, G-X., Dang, H., Tian, M., Zhang, J., Shodhan, A., Ning, Y-Z., Xiong, J. & Miao, W., 2016, in: Cell Cycle. 15, 14, S. 1855-1864 10 S.

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  Open Access

  • Proliferating Cell Nuclear Antigen 100%
  • Chromosome Segregation 100%
  • Anaphase 100%
  • Tetrahymena thermophila 100%
  • Meiosis 100%

• Dbl2 Regulates Rad51 and DNA Joint Molecule Metabolism to Ensure Proper Meiotic Chromosome Segregation

  Polakova, S., Molnarova, L., Hyppa, R. W., Benkö, Z., Misova, I., Schleiffer, A., Smith, G. R. & Gregan, J., 1 Juni 2016, in: PLoS Genetics. 12, 6, 26 S., e1006102.

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  Open Access

  • Chromosome Segregation 100%
  • Metabolic Pathway 100%
  • Meiosis 100%
  • Cell Mutant 66%
  • Helicase 33%

• DNA double-strand break formation and repair in Tetrahymena meiosis

  Loidl, J. & Lorenz, A., 1 Juni 2016, in: Seminars in Cell and Developmental Biology. 54, S. 126-134 9 S.

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  Open Access

  • Meiosis 100%
  • Eukaryote 100%
  • Double-Strand DNA Break 100%
  • Tetrahymena 100%
  • Meiotic Recombination 66%

• Laser microsurgery reveals conserved viscoelastic behavior of the kinetochore

  Cojoc, G., Roscioli, E., Zhang, L., Garcia-Ulloa, A., Shah, J. V., Berns, M. W., Pavin, N., Cimini, D., Tolic, I. M. & Gregan, J., 28 März 2016, in: The Journal of Cell Biology (JCB). 212, 7, S. 767-776 10 S.

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  Open Access

  • Kinetochore 100%
  • Fission Yeast 14%
  • Kinetochore Microtubule 7%
  • Experimental Model 7%
  • Chromosome Segregation 7%

• MEK1 is required for the development of NRAS-driven leukemia

  Nowacka, J. D., Baumgartner, C., Pelorosso, C., Roth, M., Zuber, J. & Baccarini, M., 2016, in: Onco Target. 7, 49, S. 80113-80130 18 S.

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  Open Access

  • MEK Inhibitor 100%
  • Cell Line 100%
  • Carcinogenesis 66%
  • Genome Editing 50%
  • RNAI 50%

• Nuclear envelope retention of LINC complexes is promoted by SUN-1 oligomerization in the Caenorhabditis elegans germ line

  Daryabeigi, A., Woglar, A., Baudrimont, A., Silva, N., Paouneskou, D., Vesely, C., Rauter, M., Penkner, A., Jantsch, M. & Jantsch, V., 1 Juni 2016, in: Genetics: a periodical record of investigations bearing on heredity and variation. 203, 2, S. 733-748 16 S.

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  Open Access

  • Nuclear Pore 100%
  • Caenorhabditis elegans 100%
  • Nucleoskeleton 100%
  • Germ Cell 100%
  • Nuclear Membrane 100%

• RNA(Seq) Based Transcriptional Profiling of Pseudomonas aeruginosa PA14 after Short- and Long-Term Anoxic Cultivation in Synthetic Cystic Fibrosis Sputum Medium

  Tata, M., Wolfinger, M. T., Amman, F., Roschanski, N., Doetsch, A., Sonnleitner, E., Haeussler, S. & Bläsi, U., 28 Jan. 2016, in: PLoS ONE. 11, 1, 18 S., e0147811.

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  Open Access

  • Leronlimab 100%
  • Cystic Fibrosis 100%
  • Sputum 100%
  • Antimicrobial Cationic Peptide 33%
  • Anaerobic Growth 33%

• Separable Roles for a Caenorhabditis elegans RMI1 Homolog in Promoting and Antagonizing Meiotic Crossovers Ensure Faithful Chromosome Inheritance

  Jagut, M., Hamminger, P., Woglar, A., Millonigg, S., Paulin, L., Mikl, M., Dello Stritto, M. R., Tang, L., Habacher, C., Tam, A., Gallach, M., von Haeseler, A., Villeneuve, A. M. & Jantsch, V., 24 März 2016, in: PLoS Biology. 14, 3, 29 S., e1002412.

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  Open Access

  • Caenorhabditis elegans 100%
  • Homologous Recombination 100%
  • Homologous Chromosome 20%
  • Meiosis 20%
  • Double-Strand DNA Break 20%

• SIRT2 regulates nuclear envelope reassembly through ANKLE2 deacetylation

  Kaufmann, T., Kukolj, E., Brachner, A., Beltzung, E., Bruno, M., Kostrhon, S., Opravil, S., Hudecz, O., Mechtler, K., Warren, G. & Slade, D., 15 Dez. 2016, in: Journal of Cell Science. 129, 24, S. 4607-4621 15 S.

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  Open Access

  • Progeria 100%

• The Scavenging of DPPH, Galvinoxyl and ABTS Radicals by Imine Analogs of Resveratrol

  Kotora, P., Sersen, F., Filo, J., Loos, D., Gregan, J. & Gregan, F., Jan. 2016, in: Molecules. 21, 1, 13 S., 127.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

  • Resveratrol 100%
  • 1,1 Diphenyl 2 Picrylhydrazyl 100%
  • Imine 100%
  • ABTS 100%
  • Antioxidant Capacity 28%

• Transcriptome-wide effects of inverted SINEs on gene expression and their impact on RNA polymerase II activity

  Tajaddod, M., Tanzer, A., Licht, K., Wolfinger, M. T., Badelt, S., Huber, F., Pusch, O., Schopoff, S., Janisiw, M., Hofacker, I. & Jantsch, M. F., 25 Okt. 2016, in: Genome Biology. 17, 1, 16 S., 220.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

  • RNA Polymerase II 100%
  • Transcriptome 100%
  • Alu Element 100%
  • Genome Wide Association Study 33%
  • Transposable Element 33%
• 2015

  Bisecting Galactose as a Feature of N-Glycans of Wild-type and Mutant Caenorhabditis elegans

  Yan, S., Brecker, L., Jin, C., Titz, A., Dragosits, M., Karlsson, N. G., Jantsch, V., Wilson, I. B. H. & Paschinger, K., Aug. 2015, in: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 8, S. 2111-2125 15 S.

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  • Wild Type 100%
  • Caenorhabditis elegans 100%
  • Polysaccharides 100%
  • Galactose 100%
  • Fucose 100%

• Casein Kinase 1 and Phosphorylation of Cohesin Subunit Rec11 (SA3) Promote Meiotic Recombination through Linear Element Formation

  Phadnis, N., Cipak, L., Polakova Bagelova, S., Hyppa, R. W., Cipakova, I., Anrather, D., Karvaiova, L., Mechtler, K., Smith, G. R. & Gregan, J., Mai 2015, in: PLoS Genetics. 11, 5, S. e1005225 e1005225.

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  Open Access

  • Protein Complex 100%

• Comprehensive Cross-Linking Mass Spectrometry Reveals Parallel Orientation and Flexible Conformations of Plant HOP2-MND1

  Rampler, E., Stranzl, T., Orban-Nemeth, Z., Hollenstein, D. M., Hudecz, O., Schloegehofer, P. & Mechtler, K., 4 Nov. 2015, in: Journal of Proteome Research. 14, 12, S. 5048-5062 15 S.

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  • Cross Linking 100%
  • Peptides 66%
  • Eukaryote 33%
  • Carboxy Terminal Sequence 33%
  • Double-Strand DNA Break 33%

• Exo1 and Mre11 execute meiotic DSB end resection in the protist Tetrahymena

  Lukaszewicz, A., Shodhan, A. & Loidl, J., Nov. 2015, in: DNA repair. 35, S. 137-143 7 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

  • Protist 100%
  • Tetrahymena 100%
  • Protista 100%
  • Single-Stranded DNA 60%
  • Nuclease 60%

• Molecular characterization of HIV-1 genome in fission yeast Schizosaccharomyces pombe

  Nkeze, J., Li, L., Benkö, Z., Li, G. & Zhao, R. Y., 2015, in: Cell & Bioscience. 5, 1, S. 47 47.

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  Open Access

  • Vpu 100%
  • Herpes Simplex Virus Protein Vmw65 100%
  • Colony Formation 100%