Department für Funktionelle und Evolutionäre Ökologie

2025

Advancements and challenges in microalgal protein production: A sustainable alternative to conventional protein sources

Ali, S. S., Al-Tohamy, R., Al-Zahrani, M., Schagerl, M., Kornaros, M. & Sun, J., 10 März 2025, in: Microbial Cell Factories.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Allelopathic influence of usnic acid on Physcomitrium patens: A proteomics approach

Routray, D., Petijová, L., Sabovljević, M., Lang, I., Afjehi-Sadat, L., Demko, V. & Goga, M., Feb. 2025, in: Plant Physiology and Biochemistry. 219, 109400.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

A novel type of hemoglobin confers host-derived nitric oxide resistance to the opportunistic pathogen Acinetobacter baumannii

Beas, J. Z., Folgosa, F., Karavaeva, V., Baltazar de Lima de Sousa, M. F. & Saraiva, L. M., 18 Feb. 2025, in: Scientific Reports. 15, 18 S., 5969.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

A rapid freezing method to determine tissue layer thickness in drought-stressed leaves

Zekri, M. A., Leimhofer, C., Drexler, N. & Lang, I., März 2025, in: Journal of Microscopy. 297, 3, S. 316-324 9 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Brave Genomes: Microbial Genome Plasticity in the Face of Environmental Challenge

Bulgheresi, S., 25 Feb. 2025, Elsevier Academic Press. 332 S.

Veröffentlichungen: Buch › Peer Reviewed

Coupling activated sludge models and population balance models to predict size distribution dynamics of nitrifier microcolonies in sludge flocs

Totis, N., Christiaens, A. S., Smets, I. & Waldherr, S., März 2025, in: Journal of Water Process Engineering. 71, 12 S., 107085.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Das bemerkenswerte Auftreten der Riesenschnake Tipula maxima Poda, 1761 (Diptera: Tipulidae) an heißen Tagen in subterranen Lebensräumen

Zittra, C. & Moog, O., März 2025, in: Entomologica Austriaca: Zeitschrift der Österreichischen Entomologischen Gesellschaft. 31, 8 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Distinct Patterns of Antibiotic Sensitivities in Ammonia-Oxidising Archaea

Klein, T., Hodgskiss, L. H., Dreer, M. J., Murrell, J. C., Hutchings, M. I., Schleper, C. & Lehtovirta-Morley, L. E., 11 März 2025, in: Environmental Microbiology. 27, 3, S. e70063

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Diversity and environmental distribution of Asgard archaea in shallow saline sediments

Hager, K., Luo, Z-H., Monserrat i Diez, M., Ponce Toledo, R. I., Baur, P. A., Dahlke, S., Andrei, A-S., Bulzu, P-A., Ghai, R., Ulrich, T., Glatzel, S., Schleper, C. & Rodrigues de Oliveira, T., 18 März 2025, in: Frontiers in Microbiology. 16, 1549128.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Diversity and environmental distribution of Asgard archaea in shallow saline sediments

Hager, K., Luo, Z-H., Montserrat-Diez, M., Ponce-Toledo, R. I., Baur, P., Dahlke, S., Andrei, A-S., Bulzu, P-A., Ghai, R., Urich, T., Glatzel, S., Schleper, C. & Rodrigues-Oliveira, T., 18 März 2025, in: Frontiers in Microbiology. 16, S. 1549128

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Ecological role of pelagic appendicularians in sub-Antarctic coastal and oceanic waters of the Southwest Atlantic Ocean

Alves, N., Spinelli, M. L., Martín, J., Malits, A. & Capitanio, F. L., März 2025, in: Polar Biology. 48, 1, 28.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Evidence for corrin biosynthesis in the last universal common ancestor

Modjewski, L. D., Karavaeva, V., Mrnjavac, N., Knopp, M., Martin, W. F. & Baltazar de Lima de Sousa, M. F., Feb. 2025, in: The FEBS Journal.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Fishponds Are Hotspots of Algal Biodiversity—Organic Carp Farming Reveals Unexpected High Taxa Richness

Schagerl, M., Yen, C-C., Bauer, C., Gaspar, L. & Waringer, J., 15 März 2025, in: Environments.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Future Directions of the Prokaryotic Chromosome Field

Abbondanzieri, E. A., Badrinarayanan, A. B., Barillà, D., Bell, S. D., Blombach, F., Bouet, J. Y., Bulgheresi, S., Cao, Q. A. D., Dame, R. T., Dekker, C., Demuysere, M., Espéli, O., Fogg, P. C. M., Freddolino, P. L., Ganji, M., Gerson, T. M., Grainger, D. C., Hamoen, L. W., Harju, J., Hocher, A., &30 mehrHustmyer, C. M., Kaljevic, J. K., Karney, M. K., Kleckner, N., Laloux, G., Landick, R., Lioy, V. S., Liu, W. L., Liu, C. L., Mäkelä, J., Meyer, A. S., Noy, A., Pineau, M. P., Premrajka, K., Racki, L. R., Rashid, F-Z. M., Schnetz, K., Schwab, S., Tišma, M., van der Sijs, A. I., van Heesch, T., van Raaphorst, R., Vreede, J., Walker, A. W., Walter, J-C., Weber, S. C., Wiggins, P. A., Wing, H. J., Xiao, J. & Zhang, Z., Feb. 2025, in: Molecular Microbiology. 123, 2, S. 89-100 12 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Review › Peer Reviewed

Green Synthesis of Zinc Oxide Nanoparticles as a Promising Nanomedicine Approach for Anticancer, Antibacterial, and Anti-Inflammatory Therapies

Hussien, N., Khalil, M., Schagerl, M. & Ali, S., Apr. 2025, in: International Journal of Nanomedicine.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Indicative mapping of peat and other hydromorphic organic soils across Austria with legacy data

Forstner, S. J., Brunner, T., Schwaighofer, I., Weninger, T., Weiß, M., Egger, G., Tulipan, M., Schmidt, A., Schwienbacher, M., Müller, R., Glatzel, S., Kessler, D., Starlinger, F., Kapitany, E., Wrbka, T., Haslmayr, H-P., Hummel, C., Englisch, M. & Baumgarten, A., 15 März 2025.

Veröffentlichungen: Beitrag zu Konferenz › Sonstiger Konferenzbeitrag

Internationaler Tag der Frauen und Mädchen in der Wissenschaft 2025

Zink, I. A., von Baeckmann, C. & Salomon, E., 10 Feb. 2025

Veröffentlichungen: Elektronische/multimediale Veröffentlichung › Webpublikation

Open Access

Jellyfish blooms-an overlooked hotspot and potential vector for the transmission of antimicrobial resistance in marine environments

Elena, A. X., Orel, N., Fang, P., Herndl, G. J., Berendonk, T. U., Tinta, T. & Klümper, U., 12 Feb. 2025, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: mSystems. S. e0101224

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Microplastics as persistent and vectors of other threats in the marine environment: Toxicological impacts, management and strategical roadmap to end plastic pollution

Ali, S. S., Alsharbaty, M. H. M., Al-Tohamy, R., Schagerl, M., Al-Zahrani, M., Kornaros, M. & Sun, J., 2025, in: Environmental Chemistry and Ecotoxicology. 7, S. 229-251

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Microtubules in Asgard archaea

Wollweber, F., Xu, J., Ponce-Toledo, R. I., Marxer, F., Rodrigues-Oliveira, T., Pössnecker, A., Luo, Z-H., Malit, J. J. L., Kokhanovska, A., Wieczorek, M., Schleper, C. & Pilhofer, M., 19 März 2025, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Cell.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Multifunctionality of alkaline phosphatase in ecology and biotechnology

Martinovic Saavedra, D. & Baltar, F., Feb. 2025, in: Current Opinion in Biotechnology. 91, 103229.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Review › Peer Reviewed

Open Access

Origin and biogeographical history of Palaeotropical Piper (Piperaceae): multiple long-distance dispersals from South America initiated during the Middle Eocene climatic optimum

Titel in Übersetzung: Ursprung und biogeografische Geschichte der paläotropischen Piper (Piperaceae): Mehrfache Langstreckenausbreitungen aus Südamerika, die während des Klimaoptimums im Mittleren Eozän begannenMetschina, D., Cauz-Santos, L. A., Christenhusz, M. J. M., Byng, J. W., Suwanphakdee, C., Smith, J. F., Kahandawala, I. M., Gopallawa, B., Wimalarathna, N. A., Wickramasuriya, A. M., Barfuss, M. H. J., Weiss-Schneeweiss, H., Chase, M. W. & Samuel, R., 8 Apr. 2025, in: Botanical Journal of the Linnean Society. 16 S., boaf014.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Pathways of CH4 formation and emission in the subsaline reed wetland of Lake Neusiedl

Baur, P. A., Rodrigues de Oliveira, T., Hager, K., Luo, Z-H., Schleper, C. & Glatzel, S., 2025, in: EGUsphere : the EGU interactive community platform : the preprint repository of the EGU. 30 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel

Quantitative analysis of amino acid excretion by Methanothermobacter marburgensis under N2-fixing conditions

Reischl, B., Schupp, B., Palabikyan, H., Steger-Mähnert, B., Fink, C. & Rittmann, S. K-M. R., 30 Jan. 2025, in: Scientific Reports. 15, 1, S. 3755

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Radical scavenging effect of skin delivery systems using Korean red ginseng extract and assessment of their biocompatibility with human primary dermal fibroblasts and HaCaT keratinocytes

Pfleger, T., Ortmayr, K., Steiner, K., Zaher, R., Seiser, S., Elbe-Bürger, A., Heiß, E. & Klang, V., 15 März 2025, in: International Journal of Pharmaceutics. 674, 125477, S. 125477 13 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Synergistic Antibacterial and Antibiofilm Effects of Clindamycin and Zinc Oxide Nanoparticles Against Pathogenic Oral Bacillus Species

Khalil, M. A., Alzaidi, T. M., Alsharbaty, M. H. M., Ali, S. S., Schagerl, M., Elhariry, H. M. & Aboshady, T. A., 2 Feb. 2025, in: Pathogens.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Testing the Purity of Limnospira fusiformis Cultures After Axenicity Treatments

Schagerl, M., Kaptejna, A., Polz, F., Ali, S. S., Huo, S., Seneca, J., Pjevac, P. & Hechtl, V., 17 Jan. 2025, in: Cells.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Über Grenzen hinaus: Frauen in der Spitzenforschung

Zink, I. A., von Baeckmann, C. & Salomon, E., 11 Feb. 2025

Veröffentlichungen: Elektronische/multimediale Veröffentlichung › Webpublikation

Open Access

What's in our bin? : Labs kick off and demand the transition towards a circular economy for lab plastics

Weber, P. M., Michelsen, C. & Kerou, M., 6 Jan. 2025, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: EMBO Reports.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

2024

Accelerating wheat improvement through trait characterization: advances and perspectives

Roychowdhury, R., Ghatak, A., Kumar, M., Samantara, K., Weckwerth, W. & Chaturvedi, P., Okt. 2024, in: Physiologia Plantarum. 176, 5, S. e14544 e14544.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Review › Peer Reviewed

Open Access

A critical review on plastic waste life cycle assessment and management: Challenges, research gaps, and future perspectives

Jiao, H., Ali, S. S., Alsharbaty, M. H. M., Elsamahy, T., Abdelkarim, E., Schagerl, M., Al-Tohamy, R. & Sun, J., Feb. 2024, in: Ecotoxicology and Environmental Safety. 271, 115942.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Review › Peer Reviewed

Open Access

A dynamic duo: Understanding the roles of FtsZ and FtsA for Escherichia coli cell division through in vitro approaches

Radler, P. & Loose, M., März 2024, in: European Journal of Cell Biology. 103, 1, 151380.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Review › Peer Reviewed

A dynamic model of growth phase of bio-conversion of methane to polyhydroxybutyrate using dynamic flux balance analysis

Nasershariat, M., Pishvaie, M. R., Boozarjomehry, R. B. & Waldherr, S., Apr. 2024, in: Bioprocess and Biosystems Engineering. 47, 4, S. 463-474 12 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

A giant virus infecting the amoeboflagellate Naegleria

Arthofer, P., Panhölzl, F., Delafont, V., Hay, A., Reipert, S., Cyran, N., Wienkoop, S., Willemsen, A., Sifaoui, I., Arberas-Jiménez, I., Schulz, F., Lorenzo-Morales, J. & Horn, M., Dez. 2024, in: Nature Communications. 15, 1, 13 S., 3307.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Animal life in the shallow subseafloor crust at deep-sea hydrothermal vents

Bright, M., Gollner, S., de Oliveira, A. L., Espada-Hinojosa, S., Fulford, A., Hughes, I. V., Hourdez, S., Karthäuser, C., Kolar, I., Krause, N., Le Layec, V., Makovec, T., Messora, A., Mitchell, J., Pröts, P., Rodríguez-Ramírez, I., Sieler, F., Sievert, S. M., Steger, J., Tinta, T., &6 mehrWinter, T. R. M., Bright, Z., Coffield, R., Hill, C., Ingram, K. & Paris, A., 15 Okt. 2024, in: Nature Communications. 15, 1, S. 1-9 8466.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

A novel three-part pharynx and its parallel evolution within symbiotic marine nematodes (Desmodoroidea, Stilbonematinae)

Pröts, P., Novotny-Diermayr, V. & Ott, J. A., 2024, in: Organisms Diversity & Evolution. 24, 3, S. 353-373 21 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Anoxygenic photosynthesis with emphasis on green sulfur bacteria and a perspective for hydrogen sulfide detoxification of anoxic environments

Kushkevych, I., Procházka, V., Vítězová, M., Dordević, D., Abd El-Salam, M. & Rittmann, S. K-M. R., 11 Juli 2024, in: Frontiers in Microbiology. 15, 1417714.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Review › Peer Reviewed

Open Access

A perspective on genetic and polygenic risk scores—advances and limitations and overview of associated tools

Schwarzerova, J., Hurta, M., Barton, V., Lexa, M., Walther, D., Provaznik, V. & Weckwerth, W., 20 Mai 2024, in: Briefings in bioinformatics. 25, 3, bbae240.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Aquatic biodiversity in the Danube River Basin: Aquatische Biodiversität im Donaueinzugsgebiet

Titel in Übersetzung: Aquatische Biodiversität im DonaueinzugsgebietMikuska, T., Cogălniceanu, D., Dokulil, M., Freyhof, J., Makovinska, J., Pall, K., Paunović, M., Strefke, K. & Teubner, K., 25 Okt. 2024, The Danube River and The Western Black Sea Coast: Complex Transboundary Management. Elsevier

Veröffentlichungen: Beitrag in Buch › Beitrag in Buch/Sammelband › Peer Reviewed

Assessing mowing intensity: A new index incorporating frequency, type of machinery, and technique

Hartlieb, M., Raubitzek, S., Berger, J. L., Staab, M., Vogt, J., Ayasse, M., Ostrowski, A., Weisser, W. & Blüthgen, N., Sept. 2024, in: Grassland Research. 3, 3, S. 264-274 11 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Automated Segmentation and 3D Reconstruction of Different Membranes from Confocal Z-Stacks

Zekri, M. A. & Lang, I., 28 Feb. 2024, The Plant Endoplasmic Reticulum: Methods and Protocols. Kriechbaumer, V. (Hrsg.). 2. Aufl. Humana, New York: Springer, S. 353-370 18 S. (Methods in Molecular Biology, Band 2772).

Veröffentlichungen: Beitrag in Buch › Beitrag in Buch/Sammelband › Peer Reviewed

Bacterial degradation of ctenophore Mnemiopsis leidyi organic matter

Fadeev, E., Hennenfeind, J. H., Amano, C., Zhao, Z., Klun, K., Herndl, G. J. & Tinta, T., 20 Feb. 2024, in: mSystems. 9, 2, 22 S., e01264-23.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Bafilomycin A1 Molecular Effect on ATPase Activity of Subcellular Fraction of Human Colorectal Cancer and Rat Liver

Bychkova, S., Bychkov, M., Dordevic, D., Vítězová, M., Rittmann, S. K-M. R. & Kushkevych, I., Feb. 2024, in: International Journal of Molecular Sciences. 25, 3, 1657.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

CAM evolution is associated with gene family expansion in an explosive bromeliad radiation

Groot Crego, C., Hess, J., Yardeni, G., de La Harpe, M., Priemer, C., Beclin, F., Saadain, S., Cauz-Santos, L. A., Temsch, E. M., Weiss-Schneeweiss, H., Barfuss, M. H. J., Till, W., Weckwerth, W., Heyduk, K., Lexer, C., Paun, O. & Leroy, T., 3 Okt. 2024, in: The Plant Cell. 36, 10, S. 4109-4131 23 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Cell-type proteomic and metabolomic resolution of early and late grain filling stages of wheat endosperm

Zhang, S., Ghatak, A., Mohammad Bazargani, M., Kramml, H., Zang, F., Gao, S., Ramšak, Ž., Gruden, K., Varshney, R. K., Jiang, D., Chaturvedi, P. & Weckwerth, W., März 2024, in: Plant Biotechnology Journal. 22, 3, S. 555-571 17 S.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

Characterization of DsrD and its interaction with the DsrAB dissimilatory sulfite reductase

Barbosa, A. C. C., Venceslau, S. S., Ferreira, D., Neukirchen, S., Baltazar de Lima de Sousa, M. F., Melo, M. N. & Pereira, I. A. C., Dez. 2024, in: Protein Science. 33, 12, e5222.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Comparative analysis of geotypic variations in the proteome of Nostoc commune

Routray, D., Ghatak, A., Chaturvedi, P., Petijová, L., Weckwerth, W., Ručová, D., Bačkor, M., Lang, I. & Goga, M., 31 Dez. 2024, in: Plant Signaling & Behavior. 19, 1, 1 S., 2370719.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

Open Access

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