Department für Funktionelle und Evolutionäre Ökologie

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  • 23 Rezension
  • 22 Editorial
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• 2024

  Polygenic Risk Score Simulation: A case study of sudden cardiovascular diseases derived from literature insights.

  Schwarzerova, J., Piherova, L., Polakovicova, P., Guziurova, S., Kutilova, E., Adamova, M., Krebsova, A., Provazník, V., Weckwerth, W. & Sitkova, R., 3 Dez. 2024, 2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine. S. 5081-5088 (IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine).

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  • Sudden Cardiac Death 100%
  • Single Nucleotide Polymorphism 100%
  • Myocardial Infarction 100%
  • Cardiovascular Risk 100%
  • Heart Infarction 100%

• Visualizing Horizontal Gene Transfer Detection in Phylogenetically Divergent Bacteria

  Schwarzerova, J., Rajasekaran, L., Jureckova, K., Nejezchlebova, J., Varga, M., Provaznik, V., Weckwerth, W. & Cejkova, D., 28 Aug. 2024, Bioinformatics and Biomedical Engineering - 11th International Conference, IWBBIO 2024, Proceedings. Rojas, I., Ortuño, F., Rojas, F., Herrera, L. J. & Valenzuela, O. (Hrsg.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, S. 267-277 11 S. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Band 14849 LNBI).

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  • Horizontal Gene Transfer 100%
  • Bacterial Genome 50%
  • Dynamics 16%
  • Genome Evolution 16%
  • Taxon 16%
• 2023

  Systematic Comparison of Advanced Network Analysis and Visualization of Lipidomics Data

  Schwarzerová, J., Olešová, D., Kvasnička, A., Friedecký, D., Varga, M., Provazník, V. & Weckwerth, W., 23 Juni 2023, Bioinformatics and Biomedical Engineering - 10th International Work-Conference, IWBBIO 2023, Proceedings. Rojas, I., Valenzuela, O., Rojas Ruiz, F., Herrera, L. J. & Ortuño, F. (Hrsg.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, S. 378-389 12 S. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Band 13919 LNBI).

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  • Interpretability 100%
  • Early Detection 100%
  • Clinical Data 100%
  • visualization method 100%
  • Clinical Diagnostics 100%

• Utilizing Genetic Programming to Enhance Polygenic Risk Score Calculation

  Hurta, M., Schwarzerová, J., Nägele, T., Weckwerth, W., Provaznik, V. & Sekanina, L., 2023, 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). IEEE, S. 3782-3787 6 S. (IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine).

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  • Polygenic Score 100%
  • Genetic Programming 100%
  • Genetic Predisposition 100%
  • Case Study 100%

• Visitor management and wildlife trapping in the Danube floodplain Wachau.

  Scheiblechner, U. & Teubner, K., 23 Juni 2023, Tackling present and future environmental challenges of a European riverscape. IAD Proceedings. Teubner, K., Trichkova, T. & Cvijanović, D. (Hrsg.). International association for Danube research, 11 S. (IAD Proceedings, Band 44. IAD conference, Krems).

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• 2022

  Decipher groundwater food web interactions by means of stable isotope and gut microbiome analyses

  Griebler, C., Karwautz, C., Grabner, M., Salvador, A. J., Puff, F., Kumar, R-R., Lauritz, M., Vinkovic, L., Kiralyhidi, J., Steniczka, G. & Fuchs, A., 14 Juli 2022, Proceedings of the 25th International Conference on Subterranean Biology.

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• Is There a Relationship between Biofilm Forming-Capacity and Antibiotic Resistance in Staphylococcus spp.? In Vitro Results

  Donadu, M. G., Ferrari, M., Mazzarello, V., Zanetti, S., Kushkevych, I., Rittmann, S. K-M. R., Stájer, A., Ónodi, B., Baráth, Z., Urban, E. & Gajdács, M., 15 Juni 2022, Medical Sciences Forum: Proceedings of The 2nd International Electronic Conference on Antibiotics—Drugs for Superbugs: Antibiotic Discovery, Modes of Action and Mechanisms of Resistance). 1 Aufl. Band 12.

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  Open Access

• Linear Predictive Modeling for Immune Metabolites Related to Other Metabolites

  Schwarzerová, J., Pierides, I., Sedlar, K. & Weckwerth, W., 8 Juni 2022, Bioinformatics and Biomedical Engineering - 9th International Work-Conference, IWBBIO 2022, Proceedings. Rojas, I., Valenzuela, O., Rojas, F., Herrera, L. J. & Ortuño, F. (Hrsg.). Springer International Publishing AG , S. 16-27 12 S. (Lecture Notes in Computer Science, Band 13346).

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  • Metabolite 100%
  • Predictive Modeling 100%

• Longitudinal distribution patterns of Ephemeroptera, Plecoptera and Trichoptera in a lake outlet in Lunz (Lower Austria).

  Sarkezi, M. & Waringer, J., 2022, Entomologica Austriaca 29: 353-354. . Band 29. S. 353-354

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• Nachweis von heimischen und potenziell invasiven Stechmücken am Wiener Zentralfriedhof im Jahr 2021

  Unterköfler, M., Schreier, L., Wiesbauer, U., Zittra, C., Grätzl, A., Prossegger, C., Shahi Barogh, B., Bakran-Lebl, K. & Fuehrer, H-P., 19 März 2022, Entomologica Austriaca. S. 359–360 2 S. 29

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• State of the Cetacean Environment Report (SOCER) 2021 (Pacific Ocean).

  Stachowitsch, M., Rose, N. & Parsons, E. C. M., 2022, The Future of Cetaceans in a Changing World . 25 S.

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• Systems biology approach for analysis of mobile genetic elements in chicken gut microbiome

  Schwarzerová, J., Zeman, M., Rychlik, I., Weckwerth, W., Provaznik, I., Dolejská, M. & Ceijková, D., 2022, 2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). Adjeroh, D., Long, Q., Shi, X., Guo, F., Hu, X., Aluru, S., Narasimhan, G., Wang, J., Kang, M., Mondal, A. M. & Liu, J. (Hrsg.). IEEE, S. 2865-2870 6 S. (IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine).

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  Open Access

  • Integrative Plasmid 100%
• 2021

  An Innovative Perspective on Metabolomics Data Analysis in Biomedical Research Using Concept Drift Detection

  Schwarzerova, J., Bajger, A., Pierides, I., Popelinsky, L., Sedlar, K. & Weckwerth, W., 9 Dez. 2021, 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) . Huang, Y., Kurgan, L., Luo, F., Hu, X. T., Chen, Y., Dougherty, E., Kloczkowski, A. & Li, Y. (Hrsg.). S. 3075-3082 8 S. (IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine).

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  • Concept Drift Detection 100%
  • Metabolome 100%
  • Biomedical Research 100%
  • Molecular Network 100%
  • Machine Learning 66%

• Characterization of three different carbonic anhydrases for CO2 sequestration

  Steger, F., Reich, J., Fuchs, W., Ribitsch, D., Rittmann, S. K-M. R. & Bochmann, G., 2021, Webinar series on biological carbon capture and utilization (BCCU) Proceedings.

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• New Emphasis on Water Clarity as Socio-Ecological Indicator for Urban Water – a short illustration

  Titel in Übersetzung: Neue Bewertung der Wassertransparenz als sozio-ökologischer Indikator für städtische Gewässer – eine kurze VeranschaulichungTeubner, K., Teubner, I. E., Pall, K., Kabas, W., Tolotti, M., Ofenböck, T. & Dokulil, M., 9 Juni 2021, Rivers and Floodplains in the Anthropocene - Upcoming Challenges in the Danube River Basin, Extended Abstracts 43rdIAD-conference. Aueninstitut Neuburg/Donau, Germany: Aueninstitut Neuburg/Donau, Deutschland, S. 70-78

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  Open Access

• Operation of a continuous anaerobic trickle-bed reactor for microbial acetate production

  Marzynski, M., Neubauer, M., Fuchs, W., Schulze, S., Deutsch, M., Ergal, I., Steger, F., Rachbauer, L., Rittmann, S. K-M. R., Bochmann, G. & Drosg, B., 2021, Webinar series on biological carbon capture and utilization (BCCU) Proceedings.

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• 2019

  Competing acetate consumption and production inside a microbial electrolysis cell

  Hasibar, B., Ergal, I., Bochmann, G., Rittmann, S. K-M. R. & Fuchs, W., 2019, Book of Abstracts – Workshop on Gas in Biotechnology.

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• H2/CO2 fed-batch cultivation of Methanobacterium thermaggregans

  Mauerhofer, L-M., Reischl, B., Schmider, T., Schupp, B., Nagy, K., Pappenreiter, P., Zwirtmayr, S., Bernhard, S., Seifert, A. H., Paulik, C. & Rittmann, S. K-M. R., 2019, Book of Abstracts – Workshop on Gas in Biotechnology 2019.

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• Synthetic Dissolved Organic Matter Increases River Carbon Load during a large Cultural Event

  Harjung, A., Aigner, V., Krlovic, N., Schagerl, M. & Schelker, J., 2019, Proceedings EGU meeting 2019.

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• The physiology of dark fermentative biohydrogen production

  Ergal, I., Fuchs, W., Hasibar, B., Bochmann, G. & Rittmann, S. K-M. R., 2019, Book of Abstracts – Workshop on Gas in Biotechnology 2019.

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• The physiology of methanogens in the presence of inorganic and organic compounds

  Abdel Azim, A-L., Rittmann, S. K-M. R., Fino, D. & Bochmann, G., 2019, Book of Abstracts – Workshop on Gas in Biotechnology 2019.

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• Utilization of formate by the Crenarchaeon Desulfurococcus amylolyticus DSM 16532

  Rittmann, S. K-M. R., Reischl, B. & Ergal, I., 2019, Book of Abstracts – Workshop on Gas in Biotechnology.

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• 2018

  Beyond pollination syndromes: disentangling complex vertebrate pollination systems in the genus Meriania (Melastomataceae)

  Dellinger, A., Scheer, L. M., Fernandez-Fernandez, D. M., Penneys, D. S., Tenhaken, R., Dötterl, S. & Schönenberger, J., 2018, XI International Symposium on Pollination: Abstracts.

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• Beyond pollination syndromes: disentangling complex vertebrate pollination systems in the genus Meriania (Melastomataceae)

  Dellinger, A., Scheer, L. M., Artuso, S., Fernandez-Fernandez, D. M., Penneys, D. S., Sornoza, F., Tenhaken, R., Dötterl, S. & Schönenberger, J., 2018, PopBio 2018: 31st Conference of the Plant Population Biology Section of the Ecological Society of Germany, Austria and Switzerland (GfÖ): Abstracts.

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• Disentangling the effects of discharge and temperature on CO2 production in the hyporheic zone of an alpine stream

  Boodoo, K., Battin, T., Fasching, C., Schmidt, C. & Trauth, N., 2018, Disentangling the effects of discharge and temperature on CO2 production in the hyporheic zone of an alpine stream.

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• Structure and physiology of giant chloroplasts in the deep shade adapted lycopod Selaginella erythropus

  Ghaffar, R., Weidinger, M., Steger-Mähnert, B., Schagerl, M. & Lichtscheidl-Schultz, I., 2018, Conference Book 22nd Meeting Austrian Society of Plant Biology (ATSPB) . S. 36

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• Yeast in bioremediation – experiments with Arabidopsis arenosa on zinc contaminated soils

  Sidra, S-S., Weidinger, M., Lang, I. & Lichtscheidl-Schultz, I., 2018, Conference Book 22nd Meeting Austrian Society of Plant Biology (ATSPB). University of Graz, S. 64

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  Open Access
• 2017

  Benefits of mosquito surveillance programs in protected areas: two case reports from Eastern Austria

  Zittra, C., Vitecek, S., Uebleis, S., Waringer, J. & Führer, H-P., 2017, Conference Volume of 6th Symposium for Research in Protected Areas, 2-3 November 2017, Salzburg, Austria. S. 773-775

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• Der Dragonfly Association Index (Insecta: Odonata) als Instrument zur typ-spezifischen Bewertung von Fließgewässern.

  Chovanec, A. & Waringer, J., 2017, DEUTSCHE GESELLSCHAFT FÜR LIMNOLOGIE (DGL), ERWEITERTE ZUSAMMENFASSUNGEN DER JAHRESTAGUNG 2016 (WIEN), HARDEGSEN . Hardegsen: Deutsche Gesllschaft für Limnologie, S. 84-90

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• 2016

  Die Erdkröten vom Wolfsteich - Huckepack zum Laichgewässer (Film, 11 Minuten)

  Waringer-Löschenkohl, A., 1 Nov. 2016, Verbreitung, Biologie und Schutz der Erdkröte Bufo bufo (LINNAEUS, 1758() mit besonderer Berücksichtigung des Amphibienschutzes an Strassen. Maletzky, A., Geiger, A., Kyek, M. & Nöllert, A. (Hrsg.). Mannheim: Edition Chimaira, Band Mertensiella 24. S. 226-229 4 S. (Mertensiella, Supplement zu Salamandra, Band 24).

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• Physico - chemical changes in the two rift valley lakes Bogoria and Nakuru, Kenya, over a period of 16 months including an extreme drought.

  Jirsa, F., Gruber-Dorninger, M., Stojanovic, A., Oduor, S. O., Mader, D., Körner, W. & Schagerl, M., 31 Juli 2016, Book of Abstracts. S. 404

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  • Salinity 100%
  • Dissolved Organic Carbon 100%
  • Rift Zone 100%
  • Rare Earth Element 75%
  • Trace Element 50%
• 2015

  Aspects of microalgal biomass as feedstock in biogas plants

  Gruber, M., Zoharc, E., Nussbaumer, M., Jerney, J., Montgomerya, L., Schoeppa, T., Ludwig, I., Schagerl, M., Obbard, J. P., Fuchs, W. & Drosg, B., 2015, Proceedings of the 23rd EU BC&E conference, Vienna .

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• Ein Überblick über das Stechmücken-Artinventar in Ostösterreich unter Berücksichtigung räumlicher und saisonaler Verbreitungsmuster

  Zittra, C., Eigner, B., Duscher, G. G., Lebl, K., Obwallner, G. G., Zechmeister, T. C., Waringer, J. & Führer, H-P., 2015, Entomologica Austriaca . Band 22.

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• N-uptake of Arthospira fusiformis

  Gschwandner, A. M., Angel, R., Schagerl, M. & Wöbken, D., 2015, Abstract book Fresh Blood for Fresh Water, SIL Austria, Mondsee.

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• Temperature effects on species specific food uptake of intertidal foraminifera

  Wukovits, J., Enge, A., Wanek, W., Watzka, M. & Heinz, P., 15 Juni 2015, The Foraminiferal and Nannofossil Groups Joint Spring Meeting, 2015. Plymouth

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• The Role of Callose in Avoiding Desiccation-induced Injury in Filamentous Streptophyte Green Algae

  Herburger, K., Schagerl, M. & Holzinger, A., 2015, Proceedings of the EPC6, London .

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• 2014

  Anthranilic and 3-hydroxyanthranilic acids are possible endogenous stress modulators

  Kubicova, L., Hadacek, F. & Chobot, V., 2014, Book of Abstracts 23 rd Scientific Congress of the Austrian Pharmaceutical Society. Karl-Franzens-Universität

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• Einfluss von Nassbaggerungen auf die Oberflächen- und Grundwasserqualität

  Hofmann, T., Müllegger, C., Battin, T., Kainz, M., Mathieu, F. & Weilhartner, A., Juni 2014, Abbau von Sand und Kies: Schutz des Grundwassers beim Abbau von Sand und Kies Vorstellung des ÖWAV-Regelblattes 217. 6 S.

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• Scenedesmus obliquus as Source for Biogas: Anaerobic Digestion of Untreated and Pre-treated Biomass

  Gruber, M., Zohar, E., Jerney, J., Bochmann, G., Obbard, J. P., Schagerl, M., Fuchs, W. & Drosg, B., 2014, 15. Tagung der Sektion Phykologie der DGB 2014, 23rd-26th of February 2014, Stralsund. Deutsche Botanische Gesellschaft, (Actualia: Tagungsbericht).

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• 2013

  Austrian Biodiversity Initiative for Protected Areas

  Schulze, C., Gereben-Krenn, B-A. & Schiemer, F., 2013, 5th Symposium for Research in Protected Areas, Mittersill, Austria.

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• Ecology of Arthrospira fusiformis

  Schagerl, M. & Oduor, S. O., 2013, Abstract book of the 1st Soda lake Workshop, Naivasha .

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• Frogs in the city: problems of research and conservation of amphibians in Lobau (Vienna, Donau-Auen National Park)

  Gollmann, G., Schedl, H., Philippi, D., Reckendorfer, W. & Waringer-Löschenkohl, A., 2013, Conference Volume, 5th Symposium for Research in Protected Areas from 10 to 12 June 2013. Mittersill: Salzburger Nationalparkfonds, S. 227-230 4 S.

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• Phylogenetic (SSU) and Fatty Acid Analysis of Several Algal Strains within the Trebouxiophyceae and Implications for Commercial Purposes

  Gruber, M., Darienko, T., Pröschold, T., Jirsa, F. & Schagerl, M., 2013, 21st European Biomass Conference and Exhibition. (Proceedings of the EU BC&E conference).

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• Phytoplankton community of Lake Bogoria: a microcosm experiment tot he predicted high rainfall events due to Climate Change

  Oduor, S. O., Angorm, M. & Schagerl, M., 2013, Abstract book of the 1st Soda lake Workshop, Naivasha .

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• Plankton in tropical soda lakes: aperiodic dynamics and coupling between primary producers and consumers

  Burian, A., Schagerl, M., Yasindi, A., Kainz, M. & Singer, G., 2013, Abstract book of the 1st Soda lake Workshop, Naivasha .

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• Projekte und Initiativen des Botanischen Gartens der Universität Wien (HBV) zur Erhaltung von Steppenpflanzen am Beispiel von Artemisia pancicii und Dracocephalum austriacum

  Schumacher, F., Grünweis, F., Knickmann, B., Maier, R., Prehsler, D., Tod, F. & Kiehn, M., 2013, Steppenlebensräume Europas - Gefährdung, Erhaltungsmaßnahmen und Schutz. Baumbach, H. & Pfützenreuter, S. (Hrsg.). Erfurt, Deutschland, S. 385-394

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• The importance of small gallery forest strips as biological corridors for forest species in a human-dominated landscape in southern Costa Rica

  Hofhansl, F., Seaman, B., Binz, H., Riedl, I. G., Schneeweihs, S. & Schulze, C., 2013, Biological Corridors as Conservation Tool for Increasing Permeability of Human-Dominated Tropical Landscapes for Forest Species. S. 33-36

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• Untersuchungen zur diffusen lateralen Sediment-Konnektivität in einem kleinen, ackerbaulich genutzten Einzugsgebiet der Österreichischen Böhmischen Masse

  Pöppl, R., Keiler, M., von Elverfeldt, K., Zweimüller, I. & Glade, T., 2013, Beiträge zum 44. Jahrestreffen des Arbeitskreises Hydrologie vom 15.-17. November 2012 in Lunz am See. Chifflard, P., Cyffka, B., Karthe, D. & Wetzel, K-F. (Hrsg.). Augsburg, Band 13. S. 131-133 4 S. (Geographica Augustana. Manuskripte, Band 13).

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• 2012

  Einfluss von Nassbaggerungen auf die Grundwassserqualität

  Müllegger, C., Battin, T., Kainz, M. J., Mathieu, F., Weilhartner, A. & Hofmann, T., 2012, Wasser 2012: Jahrestagung der Wasserchemischen Gesellschaft, 14.-16. Mai 2012 in Neu-Ulm. Frankfurt am Main: Deutsche Wasserchemische Gesellschaft

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• Fighting planktic algae with benthic algae: a pilot study at the Heustadelwasser in Vienna

  Mayr, M., Jerney, J. & Schagerl, M., 2012, Tagungsband der 14. Tagung der Sektion Phykologie der DBG, Wuppertal.

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