Department für Mikrobiologie und Ökosystemforschung

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• 2024

  Adaptations to nitrogen availability drive ecological divergence of chemosynthetic symbionts

  Morel-Letelier, I., Yuen, B., Kück, A. C., Camacho-García, Y. E., Petersen, J. M., Lara, M., Leray, M., Eisen, J. A., Osvatic, J. T., Gros, O. & Wilkins, L. G. E., 31 Mai 2024, in: PLoS Genetics. 20, 5, e1011295.

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  Open Access

• Adaptation to tolerate high doses of arabinoxylan is associated with fecal levels of Bifidobacterium longum

  Deehan, E. C., Zhang, Z., Nguyen, N. K., Perez-Muñoz, M. E., Cole, J., Riva, A., Berry, D., Prado, C. M. & Walter, J., 11 Juni 2024, in: Gut microbes. 16, 1, 18 S., 2363021.

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  Open Access

• A giant virus infecting the amoeboflagellate Naegleria

  Arthofer, P., Panhölzl, F., Delafont, V., Hay, A., Reipert, S., Cyran, N., Wienkoop, S., Willemsen, A., Sifaoui, I., Arberas-Jiménez, I., Schulz, F., Lorenzo-Morales, J. & Horn, M., Dez. 2024, in: Nature Communications. 15, 1, 13 S., 3307.

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  Open Access

• Apelin and the gut microbiome: Potential interaction in human MASLD

  Effenberger, M., Grander, C., Hausmann, B., Enrich, B., Pjevac, P., Zoller, H. & Tilg, H., Juni 2024, in: Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver. 56, 6, S. 932-940 9 S.

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• A pulse of simulated root exudation alters the composition and temporal dynamics of microbial metabolites in its immediate vicinity

  Wiesenbauer, J., König, A., Gorka, S., Marchand, L., Nunan, N., Kitzler, B., Inselsbacher, E. & Kaiser, C., 1 Feb. 2024, in: Soil Biology and Biochemistry. 189, 49 S., 109259.

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  Open Access

• Biomonitoring of Dietary Mycotoxin Exposure and Associated Impact on the Gut Microbiome in Nigerian Infants

  Ayeni, K. I., Seki, D., Pjevac, P., Hausmann, B., Krausová, M., Braun, D., Wisgrill, L., Berry, D., Warth, B. & Ezekiel, C. N., 6 Feb. 2024, in: Environmental Science & Technology. 58, 5, S. 2236-2246 11 S.

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  Open Access

• CAM evolution is associated with gene family expansion in an explosive bromeliad radiation

  Groot Crego, C., Hess, J., Yardeni, G., de La Harpe, M., Priemer, C., Beclin, F., Saadain, S., Cauz-Santos, L. A., Temsch, E. M., Weiss-Schneeweiss, H., Barfuss, M. H. J., Till, W., Weckwerth, W., Heyduk, K., Lexer, C., Paun, O. & Leroy, T., 30 Apr. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: The Plant Cell.

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• Chlamydiae as symbionts of photosynthetic dinoflagellates

  Maire, J., Collingro, A., Tandon, K., Parkville, T., Judd, L. M., Horn, M., Blackall, L. L. & van Oppen, M. J. H., 1 Jan. 2024, in: The ISME Journal. 18, 1, 15 S., wrae139.

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  Open Access

• Chlamydiae in corals: shared functional potential despite broad taxonomic diversity

  Maire, J., Collingro, A., Horn, M. & van Oppen, M. J. H., 15 Apr. 2024, in: ISME Communications. 4, 1, 34 S., ycae054.

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  Open Access

• Climate anomalies and neighbourhood crowding interact in shaping tree growth in old-growth and selectively logged tropical forests

  Nemetschek, D., Derroire, G., Marcon, E., Aubry-Kientz, M., Auer, J., Badouard, V., Baraloto, C., Bauman, D., Le Blaye, Q., Boisseaux, M., Bonal, D., Coste, S., Dardevet, E., Heuret, P., Hietz, P., Levionnois, S., Maréchaux, I., McMahon, S. M., Stahl, C., Vleminckx, J., &3 mehrWanek, W., Ziegler, C. & Fortunel, C., 1 März 2024, in: Journal of Ecology. 112, 3, S. 590-612 23 S.

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  Open Access

• Contrasting responses of fine root biomass and traits to large-scale nitrogen and phosphorus addition in tropical forests in the Guiana shield

  Figueiredo Lugli, L., Fuchslueger, L., Vallicrosa, H., Van Langenhove, L., Ranits, C., Roc Fernandez Garberi, P., Verryckt, L., Grau, O., Bréchet, L., Peguero, G., Llusia, J., Ogaya, R., Marquez, L., Portillo-Estrada, M., Ramirez-Rojas, I., Courtois, E., Stahl, C., Sardans, J., Penuelas, J., Verbruggen, E., &1 mehrIvan, J., Apr. 2024, in: Oikos. 2024, 4, 14 S., e10412.

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  Open Access

• Co-occurring nitrifying symbiont lineages are vertically inherited and widespread in marine sponges

  Glasl, B., Luter, H. M., Damjanovic, K., Kitzinger, K., Mueller, A. J., Mahler, L., Engelberts, J. P., Rix, L., Osvatic, J. T., Hausmann, B., Séneca, J., Daims, H., Pjevac, P. & Wagner, M., 27 Apr. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: The ISME Journal. 47 S., wrae069.

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  Open Access

• Decreasing Photoreactivity and Concurrent Change in Dissolved Organic Matter Composition With Increasing Inland Water Residence Time

  Grasset, C., Einarsdottir, K., Catalán, N., Tranvik, L. J., Groeneveld, M., Hawkes, J. A. & Attermeyer, K., März 2024, in: Global Biogeochemical Cycles. 38, 3, e2023GB007989.

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  Open Access

• Deletions of conserved extracytoplasmic function sigma factors-encoding genes in Streptomyces have a major impact on secondary metabolism

  Sekurova, O. N., Zehl, M., Predl, M., Hunyadi, P., Rattei, T. & Zotchev, S. B., 18 Juli 2024, in: Microbial Cell Factories. 23, 1, S. 201 201.

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• Direct quantification of sinking velocities across unicellular algae reveals the size-scaling and nutrient-specific regulation of cell sinking

  Miettinen, T. P., Gomez, A., Wu, Y., Wu, W., Usherwood, T. R., Hwang, Y., Roller, B. R. K., Polz, M. F. & Manalis, S. R., 5 Juli 2024, in: Science Advances. 10, 27, 12 S., eadn8356.

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  Open Access

• Discordance between mitochondrial, nuclear, and symbiont genomes in aphid phylogenetics: who is telling the truth?

  Jousselin, E., d’acier, A. C., Clamens, A-L., Galan, M., Cruaud, C., Barbe, V. & Manzano-Marín, A., 26 Aug. 2024, in: Zoological Journal of the Linnean Society. 201, 4, 18 S., zlae098.

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  Open Access

• Discovery of a novel symbiotic lineage associated with a hematophagous leech from the genus Haementeria

  Sosa-Jiménez, V. M., Kvist, S., Manzano-Marín, A. & Oceguera-Figueroa, A., 6 Juni 2024, in: Microbiology Spectrum. 12, 11 S., e04286-23.

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  Open Access

• Dynamics and drivers of fungal communities in a multipartite ant-plant association

  Barrajon-Santos, V., Nepel, M., Hausmann, B., Voglmayr, H., Woebken, D. & Mayer, V. E., 2024, in: BMC Biology. 22, 1, 15 S., 112.

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  Open Access

• Effect of micro-plastic particles on coral reef foraminifera

  Zientek, A., Schagerl, M., Nagy, M., Wanek, W., Heinz, P., Ali, S. S. & Lintner, M., Dez. 2024, in: Scientific Reports. 14, 1, 12423.

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  Open Access

• Enhancing microbiome research in sub-Saharan Africa

  Ayeni, K. I., Berry, D., Ezekiel, C. N. & Warth, B., Feb. 2024, in: Trends in Microbiology. 32, 2, S. 111-115 5 S.

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• Extended-spectrum beta-lactamase, AmpC, and carbapenemase-producing Gram-negative wastewater isolates from Aotearoa New Zealand

  Straub, C., Weaver, L., Cornelius, A. J., McGill, E., Dyet, K. & Pattis, I., Mai 2024, in: Microbiology resource announcements. 13, 5, 4 S., e0013124.

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  Open Access

• Fine root presence and increased phosphorus availability stimulate wood decay in a central Amazonian rainforest

  Martins, N. P., Valverde-Barrantes, O. J., Fuchslueger, L., Lugli, L. F., Grandis, A., Hofhansl, F., Takeshi, B., Ushida, G. & Quesada, C. A., Feb. 2024, in: Nordic Society Oikos. 2024, 2, 12 S., e09996.

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• Fungal community composition predicts forest carbon storage at a continental scale

  Anthony, M., Tedersoo, L., de Vos, B., Croise, L., Meesenburg, H., Wagner, M., Andreae, H., Jacob, F., Lech, P., Kowalska, A., Greve, M., Popova, G., Frey, B., Gessler, A., Schaub, M., Ferretti, M., Waldner, P., Calatayud, V., Canullo, R., Papitto, G., &12 mehrMarinšek, A., Ingerslev, M., Vesterdal, L., Rautio, P., Meissner, H., Timmermann, V., Dettwiler, M., Eickenscheidt, N., Schmitz, A., Van Tiel, N., Crowther, T. W. & Averill, C., 16 März 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Nature Communications. 15, 1, 13 S., 2385.

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  Open Access

• Fungal diversity in the temple with an Internal Transcribed Spacer (ITS) molecular and morphological approach

  Wijayanti, C., Kuswytasari, N. D., Shovitri, M., Danilyan, E. & Zulaika, E., 2024, in: Biodiversitas. 25, 7, S. 3151-3161 11 S.

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• Global abundance patterns, diversity, and ecology of Patescibacteria in wastewater treatment plants

  Hu, H., Kristensen, J. M., Herbold, C. W., Pjevac, P., Kitzinger, K., Hausmann, B., Dueholm, M. K. D., Nielsen, P. H. & Wagner, M., 16 März 2024, in: Microbiome. 12, 16 S., 55.

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  Open Access

• Growth of complete ammonia oxidizers on guanidine

  Palatinszky, M., Herbold, C. W., Sedlacek, C. J., Pühringer, D., Kitzinger, K., Giguere, A. T., Wasmund, K., Nielsen, P. H., Dueholm, M. K. D., Jehmlich, N., Gruseck, R., Legin, A., Kostan, J., Krasnici, N., Schreiner, C., Palmetzhofer, J., Hofmann, T., Zumstein, M., Djinović-Carugo, K., Daims, H., &1 mehrWagner, M., 19 Sep. 2024, in: Nature. 633, S. 646-653 8 S.

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  Open Access

• Hydrogen storage and geo-methanation in a depleted underground hydrocarbon reservoir

  Hellerschmied, C., Schritter, J., Waldmann, N., Zaduryan, A., Rachbauer, L., Scherr, K., Andiappan, A., Bauer, S., Pichler, M. & Loibner, A., März 2024, in: Nature Energy. 9, S. 333-344 12 S.

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  Open Access

• Impact of heavy metals (Cu, Fe, Pb, Zn) on carbon and nitrogen uptake of the diatom-bearing benthic foraminifera Heterostegina depressa

  Bubl, M., Heinz, P., Wanek, W., Schagerl, M., Hofmann, T. & Lintner, M., 30 März 2024, in: Heliyon. 10, 6, 7 S., e27229.

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  Open Access

• Impact of pesticides on marine coral reef foraminifera

  Lintner, M., Schagerl, M., Lintner, B., Wanek, W., Golen, J., Tyszka, J. & Heinz, P., Apr. 2024, in: Marine Pollution Bulletin. 201, 7 S., 116237.

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  Open Access

• Inhibition profile of three biological nitrification inhibitors and their response to soil pH modification in two contrasting soils

  Rojas-Pinzon, P. A., Prommer, J., Sedlacek, C. J., Sandén, T., Spiegel, H., Pjevac, P., Fuchslueger, L. & Giguere, A. T., 1 Juni 2024, in: FEMS microbiology ecology. 100, 6, 13 S., fiae072.

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  Open Access

• Insights into the early-life chemical exposome of Nigerian infants and potential correlations with the developing gut microbiome

  Oesterle, I., Ayeni, K. I., Ezekiel, C. N., Berry, D., Rompel, A. & Warth, B., Juni 2024, in: Environment International. 188, 108766.

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  Open Access

• Interpreting the differences in microbial carbon and nitrogen use efficiencies estimated by ¹⁸O labeling and ecoenzyme stoichiometry

  Sun, L., Qu, L., Moorhead, D. L., Cui, Y., Wanek, W., Li, S., Sang, C. & Wang, C., Apr. 2024, in: Geoderma. 444, 10 S., 116856.

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  Open Access

• Intra‐annual dynamics of soil and microbial C, N, and P pools in a Central Amazon Terra Firme forest

  Schaap, K. J., Fuchslueger, L., Hofhansl, F., Valverde-Barantes, O., Quesada, C. A. & Hoosbeek, M. R., 3 Sep. 2024, (Angenommen/In Druck) in: Journal of Plant Nutrition and Soil Science. 12 S.

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  Open Access

• Ixodid ticks and zoonotic tick-borne pathogens of the Western Balkans

  Kapo, N., Zuber Bogdanović, I., Gagović, E., Žekić, M., Veinović, G., Sukara, R., Mihaljica, D., Adžić, B., Kadriaj, P., Cvetkovikj, A., Djadjovski, I., Potkonjak, A., Velo, E., Savić, S., Tomanović, S., Omeragić, J., Beck, R. & Hodžić, A., 31 Jan. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Parasites and Vectors. 17, 1, 23 S., 45.

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  Open Access

• Long-term soil warming changes the profile of primary metabolites in fine roots of Norway spruce in a temperate montane forest

  Liu, X., Heinzle, J., Tian, Y., Salas, E., Kwatcho Kengdo, S., Borken, W., Schindlbacher, A. & Wanek, W., 27 Juni 2024, (Angenommen/In Druck) in: Plant Cell and Environment. S. 1-15 15 S.

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• Low-level resource partitioning supports co-existence among functionally redundant bacteria during successional dynamics

  Yu, X., McLean, C., Hehemann, J-H., Angeles-Albores, D., Wu, F., Muszynski, A., Corzett, C. H., Azadi, P., Kujawinski, E. B., Alm, E. & Polz, M. F., 10 Jan. 2024, in: The ISME Journal: multidisciplinary journal of microbial ecology. 18, 1, 13 S., wrad013.

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  Open Access

• Making and unmaking airports in Tunu (East Greenland). The socio-material dynamics of hope and connectivity

  Elixhauser, S., 2024, in: Études Inuit Studies. 47, 1-2, S. 275-310 47 (1-2).

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• MANNosylation of Mesoporous Silica Nanoparticles Modifies TLR4 Localization and NF-κB Translocation in T24 Bladder Cancer Cells

  Hohagen, M., Sánchez, L., Herbst, A. J., Kählig, H., Shin, J. W., Berry, D., Del Favero, G. & Kleitz, F., 5 Juli 2024, in: Advanced Healthcare Materials. 13, 17, 2304150.

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  Open Access

• Maximizing efficiency in sedimentary ancient DNA analysis: a novel extract pooling approach

  Oberreiter, V., Gelabert, P., Brück, F., Franz, S., Zelger, E., Szedlacsek, S., Cheronet, O., Cano, F. T., Exler, F., Zagorc, B., Karavanić, I., Banda, M., Gasparyan, B., Straus, L. G., Gonzalez Morales, M. R., Kappelman, J., Stahlschmidt, M., Rattei, T., Kraemer, S. M., Sawyer, S., &1 mehrPinhasi, R., 20 Aug. 2024, in: Scientific Reports. 14, 1, S. 19388 19388.

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  Open Access

• Metabolic and phylogenetic diversity in the phylum Nitrospinota revealed by comparative genome analyses

  Kop, L. F. M., Koch, H., Jetten, M. S. M., Daims, H. & Lücker, S., 10 Jan. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: ISME Communications. 4, 1, 15 S., ycad017.

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  Open Access

• Metabolite release by nitrifiers facilitates metabolic interactions in the ocean

  Bayer, B., Liu, S., Louie, K., Northen, T. R., Wagner, M., Daims, H., Carlson, C. A. & Santoro, A. E., 8 Sep. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: The ISME Journal. 27 S., wrae172.

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  Open Access

• Microbial adaption to stoichiometric imbalances regulated the size of soil mineral-associated organic carbon pool under continuous organic amendments

  Mao, X., Sun, T., Zhu, L., Wanek, W., Cheng, Q., Wang, X., Zhou, J., Liu, X., Ma, Q., Wu, L. & Jones, D. L., 1 Mai 2024, in: Geoderma. 445, 14 S., 116883.

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• Microorganisms in subarctic soils are depleted of ribosomes under short-, medium-, and long-term warming

  Söllinger, A., Ahlers, L. S., Dahl, M. B., Sigurðsson, P., Le Noir de Carlan, C., Bhattarai, B., Gall, C., Martin, V. S., Rottensteiner, C., Motleleng, L. L., Breines, E. M., Verbruggen, E., Ostonen, I., Sigurdsson, B. D., Richter, A. & Tveit, A. T., 9 Mai 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: The ISME Journal. 18, 1, 10 S., wrae081.

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• Microplastic-contamination in the flesh and gastrointestinal tract of nile tilapia (Oreochromis niloticus) reared in floating net cages at lake Ranu Grati, Pasuruan, East Java, Indonesia

  Aunurohim, A., Raufanda, M. S., Saptarini, D., Muzaki, F. K., Prabowo, R. E., Pamungkas, M. S. A., Putra, S. C. P., Ekawati, E., Maulidhaturrafida, N., Dewi, S. C. & Danilyan, E., Okt. 2024, in: Environmental Advances. 17, 100587.

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  Open Access

• Neuroactive metabolites and bile acids are altered in extremely premature infants with brain injury

  Pristner, M., Wasinger, D., Seki, D., Klebermaß-Schrehof, K., Berger, A., Berry, D., Wisgrill, L. & Warth, B., 16 Apr. 2024, in: Cell Reports Medicine. 5, 4, 24 S., 101480.

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  Open Access

• Nitrous oxide respiration in acidophilic methanotrophs

  Awala, S. I., Gwak, J-H., Kim, Y., Jung, M-Y., Dunfield, P. F., Wagner, M. & Rhee, S-K., 18 Mai 2024, in: Nature Communications. 15, 1, 18 S., 4226.

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• One Health Education Nexus: enhancing synergy among science-, school-, and teacher education beyond academic silos

  Hobusch, U., Scheuch, M., Heuckmann, B., Hodzic, A., Hobusch, G. M., Rammel, C., Pfeffer, A., Lengauer, V. H. & Froehlich, D., 22 März 2024, in: Frontiers in Public Health. 11, 11 S., 1337748.

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• Overview: Global change effects on terrestrial biogeochemistry at the plant–soil interface

  Fuchslueger, L., Solly, E. F., Canarini, A. & Brangari, A. C., 6 Sep. 2024, in: Biogeosciences. 21, 17, S. 3959-3964 6 S., 21.

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• Persistent activity of aerobic methane-oxidizing bacteria in anoxic lake waters due to metabolic versatility

  Schorn, S., Graf, J. S., Littmann, S., Hach, P. F., Lavik, G., Speth, D. R., Schubert, C. J., Kuypers, M. M. M. & Milucka, J., 21 Juni 2024, in: Nature Communications. 15, 1, 14 S., 5293.

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• Physiological basis for atmospheric methane oxidation and methanotrophic growth on air

  Schmider, T., Hestnes, A. G., Brzykcy, J., Schmidt, H., Schintlmeister, A., Roller, B. R. K., Teran, E. J., Söllinger, A., Schmidt, O., Polz, M. F., Richter, A., Svenning, M. M. & Tveit, A. T., Dez. 2024, in: Nature Communications. 15, 1, 15 S., 4151.

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