Zentrum für Mikrobiologie und Umweltsystemwissenschaft

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• 2024

  Acute stress reduces effortful prosocial behaviour

  Forbes, P. AG., Aydogan, G., Braunstein, J., Todorova, B., Anderson-Wagner, I., Lockwood, P. L., Apps, M. AJ., Ruff, C. C. & Lamm, C., 5 Jan. 2024, in: eLife. 12, 40 S., RP87271.

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  Open Access

• Adaptations to nitrogen availability drive ecological divergence of chemosynthetic symbionts

  Morel-Letelier, I., Yuen, B., Kück, A. C., Camacho-García, Y. E., Petersen, J. M., Lara, M., Leray, M., Eisen, J. A., Osvatic, J. T., Gros, O. & Wilkins, L. G. E., 31 Mai 2024, in: PLoS Genetics. 20, 5, e1011295.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Adaptation to tolerate high doses of arabinoxylan is associated with fecal levels of Bifidobacterium longum

  Deehan, E. C., Zhang, Z., Nguyen, N. K., Perez-Muñoz, M. E., Cole, J., Riva, A., Berry, D., Prado, C. M. & Walter, J., 11 Juni 2024, in: Gut microbes. 16, 1, 18 S., 2363021.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Advancing Selective Extraction: A Novel Approach for Scandium, Thorium, and Uranium Ion Capture

  Protsak, I., Stockhausen, M., Brewer, A., Owton, M., Hofmann, T. & Kleitz, F., Aug. 2024, in: Small Science.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• A giant virus infecting the amoeboflagellate Naegleria

  Arthofer, P., Panhölzl, F., Delafont, V., Hay, A., Reipert, S., Cyran, N., Wienkoop, S., Willemsen, A., Sifaoui, I., Arberas-Jiménez, I., Schulz, F., Lorenzo-Morales, J. & Horn, M., Dez. 2024, in: Nature Communications. 15, 1, 13 S., 3307.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Analytical methodological adaptations for sampling ancient pigments in provenance research

  Rodler-Rørbo, A., Brøns, C., Tepe, N., Van Ham-Meert, A., Artioli, G., Frei, R., Hofmann, T. & Koeberl, C., 1 Sep. 2024, in: Journal of Cultural Heritage. 69, S. 126-134 9 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

• An integrated approach to testing and assessment (IATA) to support grouping and read-across of nanomaterials in aquatic systems

  Cross, R. K., Spurgeon, D., Svendsen, C., Lahive, E., Little, S., von der Kammer, F., Loosli, F., Matzke, M., Fernandes, T. F., Stone, V., Peijnenburg, W. J. G. M. & Bleeker, E. A. J., Feb. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Nano Today. 54, 16 S., 102065.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Apelin and the gut microbiome: Potential interaction in human MASLD

  Effenberger, M., Grander, C., Hausmann, B., Enrich, B., Pjevac, P., Zoller, H. & Tilg, H., Juni 2024, in: Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver. 56, 6, S. 932-940 9 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

• A pulse of simulated root exudation alters the composition and temporal dynamics of microbial metabolites in its immediate vicinity

  Wiesenbauer, J., König, A., Gorka, S., Marchand, L., Nunan, N., Kitzler, B., Inselsbacher, E. & Kaiser, C., 1 Feb. 2024, in: Soil Biology and Biochemistry. 189, 49 S., 109259.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• A versatile test system to determine nanomaterial heteroagglomeration attachment efficiency

  Walch, H., Basic, N., Praetorius, A., von der Kammer, F. & Hofmann, T., 1 Feb. 2024, in: Environmental Science: Nano. 11, 2, S. 588-600 13 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Biodegradation of Water-Soluble Polymers by Wastewater Microorganisms: Challenging Laboratory Testing Protocols

  Kintzi, A., Daturpalli, S., Battagliarin, G. & Zumstein, M., 27 Aug. 2024, in: Environmental Science & Technology. 58, 34, S. 15246-15256 11 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Biodiversität in Moorböden: Neue Mikroorganismen und kryptische Redoxprozesse im Schwefelkreislauf

  Loy, A., 20 Apr. 2024, Verlag Dr. Friedrich Pfeil. 12 S. (Rundgespräche Forum Ökologie, Band 50).

  Veröffentlichungen: Buch › Peer Reviewed

• Biomonitoring of Dietary Mycotoxin Exposure and Associated Impact on the Gut Microbiome in Nigerian Infants

  Ayeni, K. I., Seki, D., Pjevac, P., Hausmann, B., Krausová, M., Braun, D., Wisgrill, L., Berry, D., Warth, B. & Ezekiel, C. N., 6 Feb. 2024, in: Environmental Science & Technology. 58, 5, S. 2236-2246 11 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• CAM evolution is associated with gene family expansion in an explosive bromeliad radiation

  Groot Crego, C., Hess, J., Yardeni, G., de La Harpe, M., Priemer, C., Beclin, F., Saadain, S., Cauz-Santos, L. A., Temsch, E. M., Weiss-Schneeweiss, H., Barfuss, M. H. J., Till, W., Weckwerth, W., Heyduk, K., Lexer, C., Paun, O. & Leroy, T., 3 Okt. 2024, in: The Plant Cell. 36, 10, S. 4109-4131 23 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Cell size, density, and nutrient dependency of unicellular algal gravitational sinking velocities

  Miettinen, T. P., Gomez, A., Wu, Y., Wu, W., Usherwood, T. R., Hwang, Y., Roller, B. R. K., Polz, M. F. & Manalis, S. R., 5 Juli 2024, in: Science Advances. 10, 27, 12 S., adn8356.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Characterization of O₂ uncoupling in biodegradation reactions of nitroaromatic contaminants catalyzed by rieske oxygenases

  Bopp, C. E., Bernet, N. M., Pati, S. G. & Hofstetter, T. B., 9 Sep. 2024, Mononuclear Non-heme Iron Dependent Enzymes Part A: Methods in Enzymology. Bridwell-Rabb, J. (Hrsg.). ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, Band 703. S. 3-28 26 S. (Methods in Enzymology, Band 703).

  Veröffentlichungen: Beitrag in Buch › Beitrag in Buch/Sammelband › Peer Reviewed

• Chlamydiae as symbionts of photosynthetic dinoflagellates

  Maire, J., Collingro, A., Tandon, K., Parkville, T., Judd, L. M., Horn, M., Blackall, L. L. & van Oppen, M. J. H., 1 Jan. 2024, in: The ISME Journal. 18, 1, 15 S., wrae139.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Chlamydiae in corals: shared functional potential despite broad taxonomic diversity

  Maire, J., Collingro, A., Horn, M. & van Oppen, M. J. H., 15 Apr. 2024, in: ISME Communications. 4, 1, 34 S., ycae054.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Climate anomalies and neighbourhood crowding interact in shaping tree growth in old-growth and selectively logged tropical forests

  Nemetschek, D., Derroire, G., Marcon, E., Aubry-Kientz, M., Auer, J., Badouard, V., Baraloto, C., Bauman, D., Le Blaye, Q., Boisseaux, M., Bonal, D., Coste, S., Dardevet, E., Heuret, P., Hietz, P., Levionnois, S., Maréchaux, I., McMahon, S. M., Stahl, C., Vleminckx, J., &3 mehrWanek, W., Ziegler, C. & Fortunel, C., 1 März 2024, in: Journal of Ecology. 112, 3, S. 590-612 23 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Contrasting responses of fine root biomass and traits to large-scale nitrogen and phosphorus addition in tropical forests in the Guiana shield

  Figueiredo Lugli, L., Fuchslueger, L., Vallicrosa, H., Van Langenhove, L., Ranits, C., Roc Fernandez Garberi, P., Verryckt, L., Grau, O., Bréchet, L., Peguero, G., Llusia, J., Ogaya, R., Marquez, L., Portillo-Estrada, M., Ramirez-Rojas, I., Courtois, E., Stahl, C., Sardans, J., Penuelas, J., Verbruggen, E., &1 mehrIvan, J., Apr. 2024, in: Oikos. 2024, 4, 14 S., e10412.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Co-occurring nitrifying symbiont lineages are vertically inherited and widespread in marine sponges

  Glasl, B., Luter, H. M., Damjanovic, K., Kitzinger, K., Mueller, A. J., Mahler, L., Engelberts, J. P., Rix, L., Osvatic, J. T., Hausmann, B., Séneca, J., Daims, H., Pjevac, P. & Wagner, M., 27 Apr. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: The ISME Journal. 47 S., wrae069.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Cooperative binding of bivalent ligands yields new insights into the guanidine-II riboswitch

  Steuer, J., Sinn, M., Eble, F., Rütschlin, S., Böttcher, T., Hartig, J. S. & Peter, C., 1 Sep. 2024, in: NAR Genomics and Bioinformatics. 6, 3, lqae132.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Decreasing Photoreactivity and Concurrent Change in Dissolved Organic Matter Composition With Increasing Inland Water Residence Time

  Grasset, C., Einarsdottir, K., Catalán, N., Tranvik, L. J., Groeneveld, M., Hawkes, J. A. & Attermeyer, K., März 2024, in: Global Biogeochemical Cycles. 38, 3, e2023GB007989.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Deletions of conserved extracytoplasmic function sigma factors-encoding genes in Streptomyces have a major impact on secondary metabolism

  Sekurova, O. N., Zehl, M., Predl, M., Hunyadi, P., Rattei, T. & Zotchev, S. B., 18 Juli 2024, in: Microbial Cell Factories. 23, 1, S. 201 201.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Different profiles of soil phosphorous compounds depending on tree species and availability of soil phosphorus in a tropical rainforest in French Guiana

  Gargallo-Garriga, A., Sardans, J., Llusià, J., Peguero, G., Ayala-Roque, M., Courtois, E. A., Stahl, C., Urban, O., Klem, K., Nolis, P., Pérez-Trujillo, M., Parella, T., Richter, A., Janssens, I. A. & Peñuelas, J., 12 Apr. 2024, in: BMC Plant Biology. 24, 1, 14 S., 278.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Discordance between mitochondrial, nuclear, and symbiont genomes in aphid phylogenetics: who is telling the truth?

  Jousselin, E., d’acier, A. C., Clamens, A-L., Galan, M., Cruaud, C., Barbe, V. & Manzano-Marín, A., 26 Aug. 2024, in: Zoological Journal of the Linnean Society. 201, 4, 18 S., zlae098.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Discovery of a novel symbiotic lineage associated with a hematophagous leech from the genus Haementeria

  Sosa-Jiménez, V. M., Kvist, S., Manzano-Marín, A. & Oceguera-Figueroa, A., 6 Juni 2024, in: Microbiology Spectrum. 12, 11 S., e04286-23.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Dynamics and drivers of fungal communities in a multipartite ant-plant association

  Barrajon-Santos, V., Nepel, M., Hausmann, B., Voglmayr, H., Woebken, D. & Mayer, V. E., 2024, in: BMC Biology. 22, 1, 15 S., 112.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Effect of micro-plastic particles on coral reef foraminifera

  Zientek, A., Schagerl, M., Nagy, M., Wanek, W., Heinz, P., Ali, S. S. & Lintner, M., Dez. 2024, in: Scientific Reports. 14, 1, 12423.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Enhanced selective extraction of indium and gallium using mesoporous sorbents

  Protsak, I., Stockhausen, M., Brewer, A., Owton, M., Hofmann, T. & Kleitz, F., 15 Okt. 2024, in: Chemical engineering journal. 498, 154468.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Enhancing microbiome research in sub-Saharan Africa

  Ayeni, K. I., Berry, D., Ezekiel, C. N. & Warth, B., Feb. 2024, in: Trends in Microbiology. 32, 2, S. 111-115 5 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Extended-spectrum beta-lactamase, AmpC, and carbapenemase-producing Gram-negative wastewater isolates from Aotearoa New Zealand

  Straub, C., Weaver, L., Cornelius, A. J., McGill, E., Dyet, K. & Pattis, I., Mai 2024, in: Microbiology resource announcements. 13, 5, 4 S., e0013124.

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  Open Access

• Fine root presence and increased phosphorus availability stimulate wood decay in a central Amazonian rainforest

  Martins, N. P., Valverde-Barrantes, O. J., Fuchslueger, L., Lugli, L. F., Grandis, A., Hofhansl, F., Takeshi, B., Ushida, G. & Quesada, C. A., Feb. 2024, in: Nordic Society Oikos. 2024, 2, 12 S., e09996.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

• Fungal community composition predicts forest carbon storage at a continental scale

  Anthony, M., Tedersoo, L., de Vos, B., Croise, L., Meesenburg, H., Wagner, M., Andreae, H., Jacob, F., Lech, P., Kowalska, A., Greve, M., Popova, G., Frey, B., Gessler, A., Schaub, M., Ferretti, M., Waldner, P., Calatayud, V., Canullo, R., Papitto, G., &12 mehrMarinšek, A., Ingerslev, M., Vesterdal, L., Rautio, P., Meissner, H., Timmermann, V., Dettwiler, M., Eickenscheidt, N., Schmitz, A., Van Tiel, N., Crowther, T. W. & Averill, C., 16 März 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Nature Communications. 15, 1, 13 S., 2385.

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  Open Access

• Fungal diversity in the temple with an Internal Transcribed Spacer (ITS) molecular and morphological approach

  Wijayanti, C., Kuswytasari, N. D., Shovitri, M., Danilyan, E. & Zulaika, E., 2024, in: Biodiversitas. 25, 7, S. 3151-3161 11 S.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

• Genomes and secondary metabolomes of Streptomyces spp. isolated from Leontopodium nivale ssp. alpinum

  Malfent, F., Zehl, M., Kirkegaard, R. H., Oberhofer, M. & Zotchev, S., 14 Juni 2024, in: Frontiers in Microbiology. 15, 1408479.

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  Open Access

• Global abundance patterns, diversity, and ecology of Patescibacteria in wastewater treatment plants

  Hu, H., Kristensen, J. M., Herbold, C. W., Pjevac, P., Kitzinger, K., Hausmann, B., Dueholm, M. K. D., Nielsen, P. H. & Wagner, M., 16 März 2024, in: Microbiome. 12, 16 S., 55.

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  Open Access

• Growth of complete ammonia oxidizers on guanidine

  Palatinszky, M., Herbold, C. W., Sedlacek, C. J., Pühringer, D., Kitzinger, K., Giguere, A. T., Wasmund, K., Nielsen, P. H., Dueholm, M. K. D., Jehmlich, N., Gruseck, R., Legin, A., Kostan, J., Krasnici, N., Schreiner, C., Palmetzhofer, J., Hofmann, T., Zumstein, M., Djinović-Carugo, K., Daims, H., &1 mehrWagner, M., 19 Sep. 2024, in: Nature. 633, S. 646-653 8 S.

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  Open Access

• Hydrogen storage and geo-methanation in a depleted underground hydrocarbon reservoir

  Hellerschmied, C., Schritter, J., Waldmann, N., Zaduryan, A., Rachbauer, L., Scherr, K., Andiappan, A., Bauer, S., Pichler, M. & Loibner, A., März 2024, in: Nature Energy. 9, S. 333-344 12 S.

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  Open Access

• Hydrolysis of Antimicrobial Peptides by Extracellular Peptidases in Wastewater

  Wichmann, N., Gruseck, R. & Zumstein, M., 9 Jan. 2024, in: Environmental Science & Technology. 58, 1, S. 717-726 10 S.

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  Open Access

• Impact of heavy metals (Cu, Fe, Pb, Zn) on carbon and nitrogen uptake of the diatom-bearing benthic foraminifera Heterostegina depressa

  Bubl, M., Heinz, P., Wanek, W., Schagerl, M., Hofmann, T. & Lintner, M., 30 März 2024, in: Heliyon. 10, 6, 7 S., e27229.

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  Open Access

• Impact of pesticides on marine coral reef foraminifera

  Lintner, M., Schagerl, M., Lintner, B., Wanek, W., Golen, J., Tyszka, J. & Heinz, P., Apr. 2024, in: Marine Pollution Bulletin. 201, 7 S., 116237.

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  Open Access

• Improving measurements of microbial growth, death, and turnover by accounting for extracellular DNA in soils

  Schnecker, J., Böckle, T., Horak, J., Martin, V., Sandén, T. & Spiegel, H., 19 Juli 2024, in: SOIL. 10, 2, S. 521-531 11 S.

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  Open Access

• Influence of plastic shape on interim fragmentation of compostable materials during composting

  Pfohl, P., Rueckel, M., Meyer, L., Battagliarin, G., Künkel, A., Hüffer, T., Zumstein, M., Hofmann, T. & Wohlleben, W., 21 März 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Microplastics and Nanoplastics. 4, 7 S., 7.

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• Influence of soil warming magnitude and duration on soluble sugar pool in fine roots and rhizomes of subarctic grasslands: Differences at species and plant community level adaptation

  Bhattarai, B., Richter, A., Metze, D., Sigurdsson, B. D., Sigurdsson, P., Leblans, N., Janssens, I. & Ostonen, I., März 2024, in: Plant Stress. 11, 11 S., 100406.

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• Inhibition profile of three biological nitrification inhibitors and their response to soil pH modification in two contrasting soils

  Rojas-Pinzon, P. A., Prommer, J., Sedlacek, C. J., Sandén, T., Spiegel, H., Pjevac, P., Fuchslueger, L. & Giguere, A. T., 1 Juni 2024, in: FEMS microbiology ecology. 100, 6, 13 S., fiae072.

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  Open Access

• Insights into the early-life chemical exposome of Nigerian infants and potential correlations with the developing gut microbiome

  Oesterle, I., Ayeni, K. I., Ezekiel, C. N., Berry, D., Rompel, A. & Warth, B., Juni 2024, in: Environment International. 188, 108766.

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  Open Access

• Interpreting the differences in microbial carbon and nitrogen use efficiencies estimated by ¹⁸O labeling and ecoenzyme stoichiometry

  Sun, L., Qu, L., Moorhead, D. L., Cui, Y., Wanek, W., Li, S., Sang, C. & Wang, C., Apr. 2024, in: Geoderma. 444, 10 S., 116856.

  Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  Open Access

• Intra‐annual dynamics of soil and microbial C, N, and P pools in a Central Amazon Terra Firme forest

  Schaap, K. J., Fuchslueger, L., Hofhansl, F., Valverde-Barantes, O., Quesada, C. A. & Hoosbeek, M. R., 3 Sep. 2024, (Angenommen/In Druck) in: Journal of Plant Nutrition and Soil Science. 12 S.

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  Open Access

• Ixodid ticks and zoonotic tick-borne pathogens of the Western Balkans

  Kapo, N., Zuber Bogdanović, I., Gagović, E., Žekić, M., Veinović, G., Sukara, R., Mihaljica, D., Adžić, B., Kadriaj, P., Cvetkovikj, A., Djadjovski, I., Potkonjak, A., Velo, E., Savić, S., Tomanović, S., Omeragić, J., Beck, R. & Hodžić, A., 31 Jan. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Parasites and Vectors. 17, 1, 23 S., 45.

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