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Martin Kuhlwilm

Ass.-Prof. Dr.

 https://orcid.org/0000-0002-0115-1797
20212025

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Suchergebnisse

  • 2025

    Intra-individual variability in ancient plasmodium DNA recovery highlights need for enhanced sampling

    Llanos-Lizcano, A., Hämmerle, M., Sperduti, A., Sawyer, S., Zagorc, B., Özdoğan, K. T., Guellil, M., Cheronet, O., Kuhlwilm, M., Pinhasi, R. & Gelabert, P., 4 Jan. 2025, in: Scientific Reports. 15, 1, 757.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access
  • 2024

    Deep genetic substructure within bonobos

    Han, S., Filippo, C. D., Parra, G., Meneu, J. R., Laurent, R., Frandsen, P., Hvilsom, C., Gronau, I., Marques-Bonet, T., Kuhlwilm, M. & Andrés, A. M., 18 Nov. 2024, in: Current Biology. 34, 22, S. 5341-5348.e3

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  • Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes

    Kuderna, L. F. K., Ulirsch, J. C., Rashid, S., Ameen, M., Sundaram, L., Hickey, G., Cox, A. J., Gao, H., Kumar, A., Aguet, F., Christmas, M. J., Clawson, H., Haeussler, M., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., &72 mehrRouselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S., Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., Zhang, G., Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Karakikes, I., Wang, K. C., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Siepel, A., Kundaje, A., Paten, B., Lindblad-Toh, K., Rogers, J., Marques Bonet, T. & Farh, K. K-H., 25 Jan. 2024, in: Nature. 625, 7996, S. 735-742 8 S.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access

  • Link between Monkeypox Virus Genomes from Museum Specimens and 1965 Zoo Outbreak

    Hämmerle, M., Rymbekova, A., Gelabert, P., Sawyer, S., Cheronet, O., Bernardi, P., Calvignac-Spencer, S., Kuhlwilm, M., Guellil, M. & Pinhasi, R., Apr. 2024, in: Emerging infectious diseases. 30, 4, S. 815-817 3 S.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access

  • Screening great ape museum specimens for DNA viruses

    Hämmerle, M., Guellil, M., Trgovec-Greif, L., Cheronet, O., Sawyer, S., Ruiz-Gartzia, I., Lizano, E., Rymbekova, A., Gelabert, P., Bernardi, P., Han, S., Rattei, T., Schuenemann, V. J., Marques-Bonet, T., Guschanski, K., Calvignac-Spencer, S., Pinhasi, R. & Kuhlwilm, M., 30 Nov. 2024, in: Scientific Reports. 14, 1, 29806.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access

  • Social and genetic diversity in first farmers of central Europe

    PERE, GELABERT., Bickle, P. F., Hofmann, D., Teschler-Nicola, M. E., Anders, A., Huang, X., Hämmerle, M., Olalde, I., Fournier, R., Ringbauer, H., Akbari, A., Cheronet, O., Lazaridis, I., Broomandkhoshbacht, N., Fernandes, D. M., Buttinger, K., Callan, K., Candilio, F., Morante, G. B., Curtis, E., &71 mehrFerry, M., Keating, D., Freilich, S., Kearns, A., Harney, É., Lawson, A. M., Mandl, K., Michel, M., Oberreiter, V., Zagorc, B., Oppenheimer, J., Sawyer, S., Schattke, C., Özdoğan, K. T., Qiu, L., Workman, J. N., Zalzala, F., Mallick, S., Mah, M., Micco, A., Pieler, F., Pavuk, J., Šefčáková, A., Lazar, C., Starović, A., Djuric, M., Škrivanko, M. K., Slaus, M., Bedić, Ž., Novotny, F., Szabó, L. D., Cserpák-Laczi, O., Hága, T., Szolnoki, L., Hajdú, Z., Mirea, P., Nagy, E. G., Virág, Z. M., Attila, H. M., Horváth, L. A., Biró, K. T., Domboróczki, L., Szeniczey, T., Jakucs, J., Szelekovszky, M., Farkas, Z., Sztáncsuj, S. J., Tóth, K., Csengeri, P., Pap, I., Patay, R., Putica, A., Vasov, B., Havasi, B., Sebők, K., Raczky, P., Lovász, G., Tvrdy, Z., Rohland, N., Novak, M., Ruttkay, M., Krošláková, M., Batora, J., Paluch, T., Borić, D., Dani, J., Kuhlwilm, M., Palamara, P. F., Hajdu, T., Pinhasi, R. & Reich, D., 29 Nov. 2024, in: Nature Human Behaviour.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  • 2023

    A global catalog of whole-genome diversity from 233 primate species

    Kuderna, L. F. K., Gao, H., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., Vries, D. D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S., &55 mehrHorvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., Melo, F. R. D., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., Silva, M. N. F. D., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., Zhang, G., Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Rogers, J., Farh, K. K-H. & Bonet, T. M., 2 Juni 2023, in: Science. 380, 6648, S. 906-913 8 S.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  • Divergent sensory and immune gene evolution in sea turtles with contrasting demographic and life histories

    Bentley, B. P., Carrasco-Valenzuela, T., Ramos, E. K. D. S., Pawar, H., Arantes, L. S., Alexander, A., Banerjee, S., Masterson, P., Kuhlwilm, M., Pippel, M., Mountcastle, J., Haase, B., Uliano-Silva, M., Formenti, G., Howe, K., Chow, W., Tracey, A., Sims, Y., Pelan, S., Wood, J., &27 mehrYetsko, K., Perrault, J., Stewart, K., Benson, S. R., Levy, Y., Todd, E., Shaffer, H. B., Scott, P., Henen, B., Murphy, R. W., Mohr, D., Scott, A. F., Duffy, D., Gemmell, N. J., Suh, A., Winkler, S., Thibaud-Nissen, F., Nery, M. F., Marques-Bonet, T., Antunes, A., Tikochinski, Y., Dutton, P. H., Fedrigo, O., Myers, E., Jarvis, E., Mazzoni, C. & Komoroske, L. M., 14 Feb. 2023, in: Proceedings of the National Academy of Sciences. 120, 7, e2201076120.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access

  • Genome-wide coancestry reveals details of ancient and recent male-driven reticulation in baboons

    Sørensen, E. F., Harris, R. A., Zhang, L., Raveendran, M., Kuderna, L. F. K., Walker, J. A., Storer, J. M., Kuhlwilm, M., Fontsere, C., Seshadri, L., Bergey, C. M., Burrell, A. S., Bergman, J., Phillips-Conroy, J. E., Shiferaw, F., Chiou, K. L., Chuma, I. S., Keyyu, J. D., Fischer, J., Gingras, M-C., &12 mehrSalvi, S., Doddapaneni, H., Schierup, M. H., Batzer, M. A., Jolly, C. J., Knauf, S., Zinner, D., Farh, K. K-H., Marques-Bonet, T., Munch, K., Roos, C. & Rogers, J., 2 Juni 2023, in: Science. 380, 6648, eabn8153.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  • Ghost admixture in eastern gorillas

    Pawar, H., Rymbekova, A., Cuadros-Espinoza, S., Huang, X., Manuel, M. D., Valk, T. V. D., Lobon, I., Alvarez-Estape, M., Haber, M., Dolgova, O., Han, S., Esteller-Cucala, P., Juan, D., Ayub, Q., Garcia, R. B., Kelley, J., Cornejo, O. E., Lao, O., Andrés, A. M., Guschanski, K., &7 mehrSsebide, B., Cranfield, M., Tyler-Smith, C., Xue, Y., Prado-Martinez, J., Marques-Bonet, T. & Kuhlwilm, M., 27 Juli 2023, in: Nature Ecology & Evolution. 7, 9, S. 1503-1514 12 S.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access

  • The landscape of tolerated genetic variation in humans and primates

    Gao, H., Hamp, T., Ede, J., Schraiber, J. G., McRae, J., Singer-Berk, M., Yang, Y., Dietrich, A. S. D., Fiziev, P., Kuderna, L. F. K., Sundaram, L., Wu, Y., Adhikari, A. N., Field, Y., Batzoglou, S., Aguet, F., Lemire, G., Reimers, R., Balick, D., Janiak, M., &30 mehrKuhlwilm, M., Orkin, J., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, FE., Calpena, L. A., Blanc, J., Gut, M., Vries, D. D., Goodhead, I., Harris, R., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I., Horvath, J., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Melo, F. R. D., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I. P., Valsecchi, J., Messias, M., Silva, M. N. F. D., Trivedi, M. & Rossi, R. V., 2 Juni 2023, in: Science. 380, 6648, eabn8197.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

  • 2022

    Population dynamics and genetic connectivity in recent chimpanzee history

    Fontsere, C., Kuhlwilm, M., Morcillo-Suarez, C., Alvarez-Estape, M., Lester, J. D., Gratton, P., Schmidt, J. M., Dieguez, P., Aebischer, T., Álvarez-Varona, P., Agbor, A., Angedakin, S., Assumang, A. K., Ayimisin, E. A., Bailey, E., Barubiyo, D., Bessone, M., Carretero-Alonso, A., Chancellor, R., Cohen, H., &68 mehrDanquah, E., Deschner, T., Dunn, A., Dupain, J., Egbe, V. E., Feliu, O., Goedmakers, A., Granjon, A-C., Head, J., Hedwig, D., Hermans, V., Hernandez-Aguilar, R. A., Imong, I., Jones, S., Junker, J., Kadam, P., Kaiser, M., Kambere, M., Kambale, M. V., Kalan, A. K., Kienast, I., Kujirakwinja, D., Langergraber, K., Lapuente, J., Larson, B., Laudisoit, A., Lee, K., Llana, M., Llorente, M., Marrocoli, S., Morgan, D., Mulindahabi, F., Murai, M., Neil, E., Nicholl, S., Nixon, S., Normand, E., Orbell, C., Ormsby, L. J., Pacheco, L., Piel, A., Riera, L., Robbins, M. M., Rundus, A., Sanz, C., Sciaky, L., Sommer, V., Stewart, F. A., Tagg, N., Tédonzong, L. R., Ton, E., van Schijndel, J., Vergnes, V., Wessling, E. G., Willie, J., Wittig, R. M., Yuh, Y. G., Yurkiw, K., Zuberbuehler, K., Hecht, J., Vigilant, L., Boesch, C., Andrés, A. M., Hughes, D. A., Kühl, H. S., Lizano, E., Arandjelovic, M. & Marques-Bonet, T., 8 Juni 2022, in: Cell Genomics. 2, 6, 39 S., 100133.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access

  • sstar: A Python package for detecting archaic introgression from population genetic data with S*

    Huang, X., Kruisz, P. & Kuhlwilm, M., Nov. 2022, in: Molecular Biology and Evolution. 39, 11, msac212.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access

  • Temporal mapping of derived high-frequency gene variants supports the mosaic nature of the evolution of Homo sapiens

    Andirkó, A., Moriano, J., Vitriolo, A., Kuhlwilm, M., Testa, G. & Boeckx, C., 15 Juni 2022, in: Scientific Reports. 12, 1, 9937.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access
  • 2021

    The genetic impact of an Ebola outbreak on a wild gorilla population

    Kuhlwilm, M., Fontsere, C., Frandsen, P., Hernandez-Rodriguez, J., Niemann, J., Scharff-Olsen, C. H., Vallet, D., Le Gouar, P., Ménard, N., Navarro, A., Siegismund, H. R., Hvilsom, C., Gilbert, M. T. P., Hughes, D. & Marquès-Bonet, T., 2021, in: BMC Genomics. 22, 1, 12 S., 735.

    Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

    Open Access